RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.61□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 Q8N3U1 123 aa10.61□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 TSKUQ8WUA8 353 aa10.61□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.61□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.61□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 NAT8Q9UHE5 227 aa10.61□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 V9GYV3 84 aa10.61□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 DNAH11Q96DT5 4516 aa10.61□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 IGHV3-30P01768 117 aa10.6□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 IGHV3-33P01772 117 aa10.6□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.6□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.6□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 RAB14P61106 215 aa10.6□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 C10orf126Q8N4M7 172 aa10.6□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.59□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 ADIRFQ15847 76 aa10.59□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 C15orf54Q8N8G6 183 aa10.59□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 GFRA4Q9GZZ7 299 aa10.59□□□□□ -0.71
ACTB-206ENST00000443528 FAM231BA6NCW3 169 aa10.58□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 HIGD1CA8MV81 97 aa10.58□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 CLLU1Q5K131 121 aa10.58□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 NFE4Q86UQ8 179 aa10.58□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.57□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 H7C1H1 209 aa10.57□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 RASL11AQ6T310 242 aa10.57□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.57□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 NIT1Q86X76 327 aa10.57□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.57□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 PKHD1P08F94 4074 aa10.57□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.55□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 A0A1B0GUT8 65 aa10.55□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 GATD1Q8NB37 220 aa10.55□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 NIT2Q9NQR4 276 aa10.55□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 SMIM15Q7Z3B0 74 aa10.54□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 NUP35Q8NFH5 326 aa10.54□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 BORCS7Q96B45 105 aa10.54□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 LAGE3Q14657 143 aa10.53□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 Q9HAA7 133 aa10.53□□□□□ -0.72
ACTB-206ENST00000443528 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 TMEM97Q5BJF2 176 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 TMEM191AQ9H0A3 160 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.52□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 KRTAP10-2P60368 255 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 FRZBQ92765 325 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 A0A087WTM6 91 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 A0A087WX48 190 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 TMEM262E9PQX1 116 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 GAS8-AS1O95177 125 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 RIGQ13278 110 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 IQCJQ1A5X6 159 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 RNF185Q96GF1 192 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 KLK12Q9UKR0 248 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 MPV17L2Q567V2 206 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 KIAA1109Q2LD37 5005 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 RAB4AP20338 218 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 AMN1Q8IY45 258 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 LRCOL1A6NCL2 159 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 C16orf90A8MZG2 172 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 PSCAO43653 123 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 GAGE6Q13070 117 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 ELOBQ15370 118 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 ATRAIDQ6UW56 229 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 Q8N976 141 aa10.47□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 PKIAP61925 76 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 UQCC3Q6UW78 93 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTB-206ENST00000443528 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 EREGO14944 169 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 PPP1R2P9O14990 202 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 ADCYAP1P18509 176 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.746e-7■■■□□ 16.1
ACTB-206ENST00000443528 RPS10P46783 165 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 RBX1P62877 108 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 COTL1Q14019 142 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 ENHOQ6UWT2 76 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 UBE2WQ96B02 151 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 MRAP2Q96G30 205 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 TMEM243Q9BU79 118 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 TM2D2Q9BX73 214 aa10.45□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 A0A1B0GXF2 115 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 TMEM218A2RU14 115 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 ANGP03950 147 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 CAMPP49913 170 aa10.44□□□□□ -0.74
ACTB-206ENST00000443528 HERC2O95714 4834 aa10.43□□□□□ -0.74
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