RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ID1P41134 155 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 Q8N1Y9 231 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGHG2P01859 326 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM95Q3KNT9 176 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DCANP1Q8TF63 244 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RHODO00212 210 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SPXQ9BT56 116 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 VCX2Q9H322 139 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SPINK13Q1W4C9 94 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C9orf85Q96MD7 179 aa10.68□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ANAPC13Q9BS18 74 aa10.68□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.68□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRSS2P07478 247 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HTN1P15515 57 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NBL1P41271 181 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZFAND6Q6FIF0 208 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.67□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM262E9PQX1 116 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RHOHQ15669 191 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TEX29Q8N6K0 151 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SPG11Q96JI7 2443 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NPC2P61916 151 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A0A0B4J2C4 111 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A0A0J9YXY3 114 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 H3BUA1 57 aa10.66□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 I3L3M4 83 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CSPG4Q6UVK1 2322 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A6NDX4 124 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LINC01620Q4KN68 170 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C10orf99Q6UWK7 81 aa10.65□□□□□ -0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C19orf84I3L1E1 186 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 M0R2P5 195 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGLV1-40P01703 118 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ATXN8Q156A1 80 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A0A0J9YX75 114 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRIAP1O43715 76 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CD28P10747 220 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TIMM21Q9BVV7 248 aa10.64□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CREBBPQ92793 2442 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CRLF1O75462 422 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PROK1P58294 105 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 Q6ZSV7 163 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRAV4A0A0B4J268 109 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A8MZ25 164 aa10.63□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SNCGO76070 127 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CITED1Q99966 193 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DUX5Q96PT3 197 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NCOR2Q9Y618 2525 aa10.62□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 K7EMT4 169 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BRI3O95415 125 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRM2P04554 102 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KNCNA6PVL3 124 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GAGE2BQ13066 116 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LY6DQ14210 128 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GAGE2EQ4V326 116 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.61□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 Q9UF83 564 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LITAFQ99732 161 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CHD8Q9HCK8 2581 aa10.6□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 B5MCH6 92 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SYNJ2BPP57105 145 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CFHR3Q02985 330 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM104AQ969W3 186 aa10.59□□□□□ -0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa10.58□□□□□ -0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 K7EQG2 157 aa10.58□□□□□ -0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 M0QXV9 152 aa10.58□□□□□ -0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C2orf82Q6UX34 121 aa10.58□□□□□ -0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CLEC2BQ92478 149 aa10.58□□□□□ -0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.58□□□□□ -0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.58□□□□□ -0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 H3BMM0 161 aa10.58□□□□□ -0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 UBE2WQ96B02 151 aa10.58□□□□□ -0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms