RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 GNG5P63218 68 aa10.68□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 LAGE3Q14657 143 aa10.68□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 ODF1Q14990 250 aa10.68□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.68□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 SPXQ9BT56 116 aa10.68□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.68□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.67□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 TIRAPP58753 221 aa10.67□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.67□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV4A0A0B4J268 109 aa10.66□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa10.66□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf196B1AJZ1 125 aa10.66□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 ORM1P02763 201 aa10.66□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 RAB5AP20339 215 aa10.66□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 ELOBQ15370 118 aa10.66□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 IMMP2LQ96T52 175 aa10.66□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 NAGKQ9UJ70 344 aa10.66□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10.65□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.65□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa10.65□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 GCGP01275 180 aa10.65□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 RAB5BP61020 215 aa10.65□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.65□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 OSTCQ9NRP0 149 aa10.65□□□□□ -0.7
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 K7EN84 100 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 M0R2P5 195 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 GNRH2O43555 120 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-30P01768 117 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-33P01772 117 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 TYMSP04818 313 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM75Q8N9X5 138 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00479Q96M42 142 aa10.64□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa10.63□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV21A0A0B4J279 112 aa10.63□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 RPS10P46783 165 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 YPEL4Q96NS1 127 aa10.63□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP30Q9Y2G7 519 aa10.63□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 GATCO43716 136 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 LTAP01374 205 aa10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 PFN1P07737 140 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 PRNTQ86SH4 94 aa10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 Q86TA4 180 aa10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 OR4C5Q8NGB2 326 aa10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 BAALCQ8WXS3 180 aa10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 IL36BQ9NZH7 164 aa10.62□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 PRR27Q6MZM9 219 aa10.61□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 FAM231DQ6ZW35 169 aa10.61□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 NHLRC2Q8NBF2 726 aa10.61□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.61□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 PSG8Q9UQ74 426 aa10.61□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 CXCL1P09341 107 aa10.6□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 SH2D6Q7Z4S9 175 aa10.6□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 SGK494Q96LW2 274 aa10.6□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.6□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa10.59□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa10.59□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N976 141 aa10.59□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 V9GYV3 84 aa10.59□□□□□ -0.71
SPCS1-201ENST00000233025 P01737 135 aa10.58□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 OR10J3Q5JRS4 329 aa10.58□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 KCNS1Q96KK3 526 aa10.58□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 MLST8Q9BVC4 326 aa10.58□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.57□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 S100A6P06703 90 aa10.57□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.57□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.57□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT11Q96G61 164 aa10.57□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf85Q96MD7 179 aa10.57□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 COX19Q49B96 90 aa10.56□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.56□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 A8MWL6 223 aa10.55□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF876PQ49A33 203 aa10.55□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 CT83Q5H943 113 aa10.55□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP82Q8N141 532 aa10.55□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa10.55□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01600Q96MT4 127 aa10.55□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa10.54□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 RHOHQ15669 191 aa10.54□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 TSKUQ8WUA8 353 aa10.54□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.53□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 XKRY2A2RUG3 117 aa10.53□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.53□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 TRGC2P03986 189 aa10.53□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 SMUG1Q53HV7 270 aa10.53□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 PTH2Q96A98 100 aa10.53□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.53□□□□□ -0.72
SPCS1-201ENST00000233025 COX11Q9Y6N1 276 aa10.53□□□□□ -0.72
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