RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 RRN3P1Q2M238 152 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 NIT1Q86X76 327 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf158Q8N1D5 194 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 WFDC10AQ9H1F0 79 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 H7C1H1 209 aa16.49■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H2BLQ99880 126 aa16.49■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM9A6NGZ8 99 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 AMTP48728 403 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 IQCJQ1A5X6 159 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 AP5S1Q9NUS5 200 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 F5H697 171 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFRSF6BO95407 300 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 POM121L12Q8N7R1 296 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 C20orf78Q9BR46 151 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 LGALS9BQ3B8N2 356 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 TGP01266 2768 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 CIDEAO60543 219 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF56Q15929 161 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf72Q8NBR9 251 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10D4PQ8NGN7 298 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 K7EMI3 77 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 NCR2O95944 276 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM6P0DI80 62 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 PRSS47A8MTI9 375 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 NPYP01303 97 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 G0S2P27469 103 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM74A4Q5TZK3 123 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 SMKR1H3BMG3 65 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 RASL10AQ92737 203 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 TCAPO15273 167 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N8P6 123 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPB8Q9UJY1 196 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087WWL8 130 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFP2Q6ZN57 461 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 ST20Q9HBF5 79 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRY2O43597 315 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 AZU1P20160 251 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01549A6NIU2 74 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 IFITM10A6NMD0 228 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYGDP07320 174 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL32P62910 135 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 OXLD1Q5BKU9 147 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 NRACQ8N912 160 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 IL17DQ8TAD2 202 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 EDA2RQ9HAV5 297 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 A8MZ25 164 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 RS1O15537 224 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 NUPR1O60356 82 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00310P59036 64 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4C5Q8NGB2 326 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 LEPROTL1O95214 131 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 ORMDL2Q53FV1 153 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZWC4 215 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 OVOL2Q9BRP0 275 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01546A6NGU7 62 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 VCYO14598 125 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00315P59091 139 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 KIR2DL4Q99706 377 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 JPT2Q9H910 190 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 NIT2Q9NQR4 276 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV4A0A0B4J268 109 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 HBDP02042 147 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP126Q5VTH2 177 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC30Q96LL9 226 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC4Q99102 2169 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 LAGE3Q14657 143 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM19A2Q8N3H0 131 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 TRGV2A0A075B6R0 118 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 C20orf202A1L168 122 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 MIFP14174 115 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 M0QY20 66 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTDAPP60985 99 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 LYRM9A8MSI8 78 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-212ENST00000591041 SCGB1D1O95968 90 aa16.3■□□□□ 0.2
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