RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	BIN3	Q9NQY0	253 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	CRYGD	P07320	174 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	OR5AL1	P0C617	328 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	LINC00315	P59091	139 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	GAGE1	Q13065	139 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	GAGE4	Q13068	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	GAGE5	Q13069	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	EVI2A	P22794	236 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469		K7EP13	123 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	LINC00694	P0DN24	101 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469		P01737	135 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	LELP1	Q5T871	98 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM250	H0YL14	139 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	GZMB	P10144	247 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	TPPP3	Q9BW30	176 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	SST	P61278	116 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469		Q9UF83	564 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	PKD1	P98161	4303 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	RAB4B	P61018	213 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF56	Q15929	161 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	TOR2A	Q5JU69	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	NFE4	Q86UQ8	179 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	RYR1	P21817	5038 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	AP1S3	Q96PC3	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	SMIM17	P0DL12	118 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	OCC1	Q8TAD7	63 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469	NUDT11	Q96G61	164 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-209	ENST00000589469		A0A087WWC5	75 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469		K7EN84	100 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	CEBPG	P53567	150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	CACNG7	P62955	275 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	FAM210A	Q96ND0	272 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469		F2Z2F3	143 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469		F5H697	171 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	IGHV3-30	P01768	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	IGHV3-33	P01772	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	PKHD1	P08F94	4074 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	UBE2D3	P61077	147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	UBE2D2	P62837	147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	TEX261	Q6UWH6	196 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	CTRL	P40313	264 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME3-209	ENST00000589469	C16orf90	A8MZG2	172 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-209	ENST00000589469	MGP	P08493	103 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-209	ENST00000589469	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-209	ENST00000589469	TRGC1	P0CF51	173 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF727	A8MUV8	499 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-209	ENST00000589469	EREG	O14944	169 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-209	ENST00000589469	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-209	ENST00000589469	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-209	ENST00000589469	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME3-209	ENST00000589469	NTF3	P20783	257 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME3-209	ENST00000589469	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.7 ms