RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574468.1

PAFAH1B1-208, Transcript of platelet activating factor acetylhydrolase 1b regulatory subunit 1, human

TSL 2

Gene PAFAH1B1, Length 1,021 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468		A0A087WTM6	91 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468		A0A0D9SG52	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468		H3BVH4	76 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468		M0R036	132 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PEX7	O00628	323 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	BCL2L11	O43521	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TEX261	Q6UWH6	196 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PARL	Q9H300	379 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SH2D1A	O60880	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	CXorf1	O96002	111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	IGHV3-30	P01768	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	IGHV3-33	P01772	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SRI	P30626	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ZNF876P	Q49A33	203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TTC32	Q5I0X7	151 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SPX	Q9BT56	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468		A0A1W2PPQ1	181 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	GAGE12J	A6NER3	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	CCL20	P78556	96 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SERF2	P84101	59 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	GAGE1	Q13065	139 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	GAGE4	Q13068	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	GAGE5	Q13069	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ZNF345	Q14585	488 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LINC01620	Q4KN68	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SLC51B	Q86UW2	128 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	NRAC	Q8N912	160 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	DERL1	Q9BUN8	251 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468		Q9HAA7	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468		A0A1W2PRE2	83 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LECT2	O14960	151 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	PAGE4	O60829	102 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	IFNA7	P01567	189 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	CRYGD	P07320	174 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SMUG1	Q53HV7	270 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TEX46	H3BTG2	121 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LTA	P01374	205 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAFAH1B1-208	ENST00000574468		B4DEV8	164 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TAAR5	O14804	337 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	IGLV2-8	P01709	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TIRAP	P58753	221 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	STOML3	Q8TAV4	291 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PAFAH1B1-208	ENST00000574468	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		5.01	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms