RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 TCAPO15273 167 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 IGLV2-8P01709 118 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 S100A6P06703 90 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 AKAIN1P0CW23 69 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 AKR1C4P17516 323 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 PSG9Q00887 426 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF345Q14585 488 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SMCO1Q147U7 214 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 RRN3P1Q2M238 152 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 DTD1Q8TEA8 209 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00052Q96N35 136 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 GPR82Q96P67 336 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 TRGV9Q99603 122 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 RPRMQ9NS64 109 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 HSPB11Q9Y547 144 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 M0R2N4 97 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SCO1O75880 301 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SLC25A6P12236 298 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 CXCL3P19876 107 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 EMP1P54849 157 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 FAM78BQ5VT40 261 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 S100A7AQ86SG5 101 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF709Q8N972 641 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0J9YX75 114 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 A8MTW9 85 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 NDUFS5O43920 106 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 TSPOP30536 169 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00315P59091 139 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 DAD1P61803 113 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF90Q03938 601 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 OR4C16Q8NGL9 310 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00477Q96M19 166 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 DOK5Q9P104 306 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF98A6NK75 572 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 PITX3O75364 302 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 MPC2O95563 127 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 HTN3P15516 51 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 CCL18P55774 89 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 FXYD7P58549 80 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 OR2F1Q13607 317 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0D9SG52 128 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1B0GW15 77 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SYNGR2O43760 224 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SSNA1O43805 119 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 ATP5G1P05496 136 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 NMBP08949 121 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 ORM2P19652 201 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 S100A11P31949 105 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 ATP5G3P48201 142 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 H2BFSP57053 126 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 RAB14P61106 215 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 PMVKQ15126 192 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 AMTNQ6UX39 209 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 SLC51BQ86UW2 128 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 STOML3Q8TAV4 291 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 PRO0628Q9UI54 55 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 KMT2AQ03164 3969 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 FNDC10F2Z333 226 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 F5H768 121 aa3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TMOD3-208ENST00000560725 HYPMO75409 117 aa3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.3 ms