RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 ZNF56Q15929 161 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 CITED1Q99966 193 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 C9orf85Q96MD7 179 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 MED14OSP0DP75 135 aa6.15□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.15□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 NRACQ8N912 160 aa6.15□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 SYT8Q8NBV8 401 aa6.15□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 IGLL1P15814 213 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 RASL10AQ92737 203 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 A0A096LNJ9 63 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 A8MTW9 85 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 EMP1P54849 157 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 MAJINQ3KP22 176 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 DNLZQ5SXM8 178 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 C3orf56Q8N813 242 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 MRAP2Q96G30 205 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 LINC00315P59091 139 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 HBDP02042 147 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 CRYGDP07320 174 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 VAMP8Q9BV40 100 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 LINC00587B1AMM8 73 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 TSTD3H0UI37 97 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 NXPH4O95158 308 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 P0DMU3 169 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 FAM231AP0DMU4 169 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 FAM231CP0DMU5 169 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 TCTAP57738 103 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 ZNF415Q09FC8 603 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 Q8N976 141 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 ZNF747Q9BV97 191 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 CSTL1Q9H114 145 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 M0R2P5 195 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 NUDT3O95989 172 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 IGHV3-53P01767 116 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 Q8N8P6 123 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 Q9UF83 564 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 INSL3P51460 131 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 LAGE3Q14657 143 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 ST20Q9HBF5 79 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 PKIAP61925 76 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 PRSS1P07477 247 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 Q6ZTI0 123 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 M0QY20 66 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 FCER1GP30273 86 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 RIPPLY3P57055 190 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 hDV102S1A0JD36 115 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 C20orf202A1L168 122 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 RRN3P1Q2M238 152 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 SPATA45Q537H7 98 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 Q6ZSN1 163 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 C20orf78Q9BR46 151 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-215ENST00000549143 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 C14orf144Q96I85 54 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 A8MWV9 139 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 PPP1R17O96001 155 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 DDTP30046 118 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-215ENST00000549143 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.08□□□□□ -1.44
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