RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 OR5AL1P0C617 328 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 LINC00614P0C842 121 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 C3orf79P0CE67 100 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 TFPI2P48307 235 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 PKIAP61925 76 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 ZNF415Q09FC8 603 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 DEFB136Q30KP8 78 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 OR11H1Q8NG94 326 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 DUX3Q96PT4 197 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 SMR3AQ99954 134 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 PRO1933Q9H354 126 aa3.98□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 D6R8Y8 96 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 M0R2Z0 102 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 HSBP1O75506 76 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 ZNF688P0C7X2 276 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 CD28P10747 220 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 PSMG4Q5JS54 123 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 LINC01006Q8NI28 216 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 PRELID3AQ96N28 172 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-205ENST00000546248 LRBAP50851 2863 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 A0A096LNJ9 63 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 TRAV2A0A0B4J234 112 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 LINC01546A6NGU7 62 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 A8MTW9 85 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 LY6G6DO95868 133 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 NPYP01303 97 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 EVI2AP22794 236 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 CKS2P33552 79 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 KRTDAPP60985 99 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 CACNG7P62955 275 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 PMCHL1Q16048 86 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 AMTNQ6UX39 209 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 ORMDL3Q8N138 153 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 ODF3Q96PU9 254 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 PTPN13Q12923 2485 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 CR1P17927 2039 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 KNCNA6PVL3 124 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 H3BVH4 76 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 NCR2O95944 276 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 PPBPP02775 128 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 DDTP30046 118 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 LEPP41159 167 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 ASIPP42127 132 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 LINC00315P59091 139 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP10-3P60369 221 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 KIR2DL5AQ8N109 375 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 C7orf71A4D174 169 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 H3BMM0 161 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 CCL24O00175 119 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 TCF21O43680 179 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 NDUFA7O95182 113 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 LEPROTL1O95214 131 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 DEFB131AP59861 70 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 CTAG1AP78358 180 aa3.94□□□□□ -1.78
TRDN-205ENST00000546248 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.1 ms