RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 DKK2Q9UBU2 259 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-216ENST00000524481 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.72□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
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PTPRK-216ENST00000524481 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.71□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 OR11H12B2RN74 326 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-216ENST00000524481 P0DMU3 169 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-216ENST00000524481 FAM231AP0DMU4 169 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-216ENST00000524481 FAM231CP0DMU5 169 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-216ENST00000524481 COTL1Q14019 142 aa8.7□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 A0A096LNJ9 63 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 SCGB2A2Q13296 93 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 HILS1P60008 231 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 Q8N2B8 174 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRK-216ENST00000524481 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 KIR2DL4Q99706 377 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 JMJD8Q96S16 334 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 MPV17L2Q567V2 206 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-216ENST00000524481 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.63□□□□□ -1.03
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