RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 K7EMI3 77 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 M0R381 172 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 NUPR1O60356 82 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 EVI2AP22794 236 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 AMTP48728 403 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 SSTP61278 116 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF415Q09FC8 603 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 LINC01587Q99440 93 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.5□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 VWFP04275 2813 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 LINC01546A6NGU7 62 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 TNFRSF6BO95407 300 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 IQCJQ1A5X6 159 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 FA2HQ7L5A8 372 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 RCHY1Q96PM5 261 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 C12orf57Q99622 126 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 C20orf78Q9BR46 151 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 MDFICQ9P1T7 246 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 A8MWV9 139 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 M0R2P5 195 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 G0S2P27469 103 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 FXYD7P58549 80 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF876PQ49A33 203 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 C3orf56Q8N813 242 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 Q8N8P6 123 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 XCL2Q9UBD3 114 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.48□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 H7C1H1 209 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 NPYP01303 97 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 PYY3Q5JQD4 70 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 NRACQ8N912 160 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 CSTL1Q9H114 145 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.47□□□□□ -1.53
SEC31A-241ENST00000515749 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 LINC01549A6NIU2 74 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 RHODO00212 210 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 TCAPO15273 167 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 CIDEAO60543 219 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 LEPROTL1O95214 131 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00315P59091 139 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 S100A12P80511 92 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 RASL10AQ92737 203 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 NIT2Q9NQR4 276 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 MAST4O15021 2626 aa5.46□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 F5H697 171 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 SMKR1H3BMG3 65 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 NCR2O95944 276 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 SCGB1D1O95968 90 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 HBDP02042 147 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 CRYGDP07320 174 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 MGPP08493 103 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 HTN1P15515 57 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 FCER1GP30273 86 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 Q6ZWC4 215 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 C16orf74Q96GX8 76 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.45□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.44□□□□□ -1.54
SEC31A-241ENST00000515749 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.1 ms