RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 VCYO14598 125 aa6.65□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 CCL8P80075 99 aa6.65□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.65□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 hADV29S1A0JD25 119 aa6.64□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 TRIAP1O43715 76 aa6.64□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 IGHV4-39P01824 125 aa6.64□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 KLK15Q9H2R5 256 aa6.64□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 PEMTQ9UBM1 199 aa6.64□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.64□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.64□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 NXPH4O95158 308 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 DOCK7Q96N67 2140 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 F8W735 103 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 TSHBP01222 138 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 RHOHQ15669 191 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 TIMM17BO60830 172 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 GPHB5Q86YW7 130 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 DAND5Q8N907 189 aa6.63□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.62□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 CACNA1EQ15878 2313 aa6.62□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.62□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 A0A0J9YXY3 114 aa6.62□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 APELAP0DMC3 54 aa6.62□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 SERP2Q8N6R1 65 aa6.62□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.61□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 BUB3O43684 328 aa6.61□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 PRAC2D3DTV9 90 aa6.61□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 CTSGP08311 255 aa6.61□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 CFHR3Q02985 330 aa6.61□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 DCANP1Q8TF63 244 aa6.61□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 NPC2P61916 151 aa6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 COPS9Q8WXC6 57 aa6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 C16orf92Q96LL3 132 aa6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 CEP290O15078 2479 aa6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.6□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.59□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 Q9UF83 564 aa6.59□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 H7C2G1 150 aa6.59□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 UBE2E1P51965 193 aa6.59□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 MIAQ16674 131 aa6.59□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 Q8NA96 180 aa6.59□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 DNAJC13O75165 2243 aa6.59□□□□□ -1.35
GPBP1-208ENST00000514387 PRSS33Q8NF86 280 aa6.58□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.58□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 MGPP08493 103 aa6.58□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.58□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 CCDC140Q96MF4 163 aa6.58□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 LITAFQ99732 161 aa6.58□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 U3KQE9 123 aa6.58□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 IGF1P05019 195 aa6.57□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 CACNA1GO43497 2377 aa6.57□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.57□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.57□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 I3L3M4 83 aa6.56□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.56□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 RNF182Q8N6D2 247 aa6.56□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.56□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 DPM3Q9P2X0 92 aa6.56□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 LINC00315P59091 139 aa6.56□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 COX7A2LO14548 114 aa6.56□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 A0A0U1RQV1 116 aa6.55□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.55□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.55□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.55□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.55□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.55□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.54□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.54□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 Q6JHZ5 121 aa6.54□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.54□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.54□□□□□ -1.36
GPBP1-208ENST00000514387 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.53□□□□□ -1.36
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