RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	CACNA1E	Q15878	2313 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAJC13	O75165	2243 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0U1RRA0	63 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX7A2L	O14548	114 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAS8-AS1	O95177	125 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD59	P13987	128 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIRPD	Q9H106	197 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM223	A0PJW6	202 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX7A1	P24310	79 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNFN	Q9BYD5	112 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549		U3KQE9	123 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	CACNA1G	O43497	2377 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0J9YXY3	114 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL3L1	P16619	93 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6JHZ5	121 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	NRAC	Q8N912	160 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOTCH4	Q99466	2003 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIMM17B	O60830	172 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX6B1	P14854	86 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAMTS20	P59510	1910 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIRAP	P58753	221 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	MIA	Q16674	131 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549		E7EUB6	86 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV1-17	P01599	117 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	PTPRB	P23467	1997 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF883	P0CG24	379 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	GATA4	P43694	442 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDP	Q00604	133 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL17	Q92583	94 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	FSTL3	O95633	263 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-23	P01764	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELANE	P08246	267 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV1-2	P23083	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFHR1	Q03591	330 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	C5orf38	Q86SI9	138 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM86B	Q8N661	226 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL21	O00585	134 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	PMAIP1	Q13794	54 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0J9YXV3	536 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFC1	O43677	76 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00311	Q8N616	119 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	DKK1	O94907	266 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	DAD1	P61803	113 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF876P	Q49A33	203 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0J9YX75	114 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV1-69	P01742	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	LPAL2	Q16609	132 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WVE0	104 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41

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