RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266		B4DEV8	164 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266		H7BYZ3	331 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNAI2	O43623	268 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNAPIN	O95295	136 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266		P01737	135 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	ORM1	P02763	201 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPO	P30536	169 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELOB	Q15370	118 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	RHEB	Q15382	184 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	JPT2	Q9H910	190 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHOX2A	O14813	284 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB4A	O15263	64 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPINK4	O60575	86 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	INS	P01308	110 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	AMBP	P02760	352 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTRL	P40313	264 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00315	P59091	139 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01587	Q99440	93 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266		A8MWL6	223 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BVH4	76 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	NXPH4	O95158	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPREB1	P12018	145 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8NAQ8	132 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	HTN1	P15515	57 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	SST	P61278	116 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q9UF83	564 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC4	Q99102	2169 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYGD	P07320	174 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	NTF3	P20783	257 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	EVI2A	P22794	236 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASIP	P42127	132 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOC4	P55056	127 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFA6	Q01524	100 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZTI0	123 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72

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