RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482195.5

DDX39B-220, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 1,232 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-220ENST00000482195 ASIPP42127 132 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 CFAP161Q6P656 301 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.74□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 A0A087WX48 190 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 H3BVH4 76 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 SSNA1O43805 119 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 PTH2Q96A98 100 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 JPT2Q9H910 190 aa6.73□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 RNF222A6NCQ9 220 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 MPC2O95563 127 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 CRPP02741 224 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 H2BFSP57053 126 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 C14orf177Q52M58 125 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 NIT1Q86X76 327 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 WFDC1Q9HC57 220 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 Q9UF83 564 aa6.72□□□□□ -1.33
DDX39B-220ENST00000482195 RHODO00212 210 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 HLA-DQA1P01909 254 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 GCHFRP30047 84 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ELOBQ15370 118 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 LINC00479Q96M42 142 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.71□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 B4DEV8 164 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 TMEM262E9PQX1 116 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 IGLV2-11P01706 119 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 STAG3L2P0CL84 134 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 STAG3L3P0CL85 134 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 PCP4P48539 62 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 Q0VG73 95 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 EPDR1Q9UM22 224 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 M0R036 132 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 MLST8Q9BVC4 326 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 USP17L23D6RBM5 183 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 M0R381 172 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 IFNA7P01567 189 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 Q6ZNX1 250 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 Q86TA4 180 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 S100ZQ8WXG8 99 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 IL36BQ9NZH7 164 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 CXorf1O96002 111 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 UBE2G2P60604 165 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.67□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 SH2D1AO60880 128 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 UPK1BO75841 260 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 MBP02144 154 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 BLOC1S1P78537 153 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF56Q15929 161 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 MPV17L2Q567V2 206 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 PEX7O00628 323 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 PTTG1O95997 202 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ATP6V0CP27449 155 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 UBE2D3P61077 147 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 UBE2D2P62837 147 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ENHOQ6UWT2 76 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 ZFP82Q8N141 532 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 SUN5Q8TC36 379 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 SFRP2Q96HF1 295 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-220ENST00000482195 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.65□□□□□ -1.34
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