RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 OCC1Q8TAD7 63 aa5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 NUDT11Q96G61 164 aa5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 AP1S3Q96PC3 154 aa5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 JPT2Q9H910 190 aa5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF727A8MUV8 499 aa5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 CACNG7P62955 275 aa5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 TTC32Q5I0X7 151 aa5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLLU1Q5K131 121 aa5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 WDR73Q6P4I2 378 aa5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A087WWL8 130 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 K7EP13 123 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 GZMBP10144 247 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC00315P59091 139 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB4BP61018 213 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 IFITM2Q01629 132 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 PEA15Q15121 130 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 GTSF1Q8WW33 167 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM231BA6NCW3 169 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 RTL8CO15255 209 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 CEBPGP53567 150 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 ISOC2Q96AB3 205 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q9H8V8 135 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 OSTCQ9NRP0 149 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 NAT8Q9UHE5 227 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRAPPC3-206ENST00000469757 A8MWL6 223 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 SIVA1O15304 175 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRGC1P0CF51 173 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB14P61106 215 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 TSKUQ8WUA8 353 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 TPPP3Q9BW30 176 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q9UF83 564 aa5.66□□□□□ -1.5
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TRAPPC3-206ENST00000469757 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 ERVFC1-1P60608 527 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 UBE2D3P61077 147 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 UBE2D2P62837 147 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF56Q15929 161 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 LELP1Q5T871 98 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A087WWC5 75 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A1B0GVY2 172 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 M0QY20 66 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 M0R2N4 97 aa5.64□□□□□ -1.51
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TRAPPC3-206ENST00000469757 EVI2AP22794 236 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 C6orf223Q8N319 242 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.64□□□□□ -1.51
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TRAPPC3-206ENST00000469757 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 GAGE12JA6NER3 117 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 HIGD1CA8MV81 97 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 H7C1H1 209 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 NTF3P20783 257 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 GAGE1Q13065 139 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 GAGE4Q13068 117 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 GAGE5Q13069 117 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADIRFQ15847 76 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 GAGE13Q4V321 117 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC3-206ENST00000469757 UQCC3Q6UW78 93 aa5.63□□□□□ -1.51
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