RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 TWIST1Q15672 202 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 AP1S3Q96PC3 154 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 GAGE12JA6NER3 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 SIVA1O15304 175 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 NXPH4O95158 308 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 EVI2AP22794 236 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 RAB4BP61018 213 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 GAGE1Q13065 139 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 GAGE4Q13068 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 GAGE5Q13069 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 ADIRFQ15847 76 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 GAGE13Q4V321 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 JPT2Q9H910 190 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 H7C1H1 209 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 SNAI2O43623 268 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 NAT8Q9UHE5 227 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 A0A087WWC5 75 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 K7EN84 100 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 NTF3P20783 257 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 WDR73Q6P4I2 378 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 LINC01551Q86U37 167 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 CRYGDP07320 174 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 Q6ZSN1 163 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 UPK3BQ9BT76 320 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 OSTCQ9NRP0 149 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 IGLC6P0CF74 106 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 CT83Q5H943 113 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 CLLU1Q5K131 121 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 LYSTQ99698 3801 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 TMEM262E9PQX1 116 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 TIRAPP58753 221 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 RIGQ13278 110 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 LELP1Q5T871 98 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 C6orf223Q8N319 242 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 TSKUQ8WUA8 353 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-208ENST00000462335 A0A1B0GUT8 65 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 HIGD1CA8MV81 97 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 C9JQL5 133 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 K7EP13 123 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 CTRLP40313 264 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 NFE4Q86UQ8 179 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 ZNF575Q86XF7 245 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 ISOC2Q96AB3 205 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 A0A087WX48 190 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 FAM231BA6NCW3 169 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 EREGO14944 169 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 PPP1R2P9O14990 202 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 IGHV3-30P01768 117 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 IGHV3-33P01772 117 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 MT-ND4LP03901 98 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 RASL11AQ6T310 242 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 Q6ZR54 194 aa6.57□□□□□ -1.36
PKP4-208ENST00000462335 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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