RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A087WWC5	75 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	JTB	O76095	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		P01737	135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	CRYBB3	P26998	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TSPO	P30536	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF345	Q14585	488 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZVH6	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC01587	Q99440	93 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	CUBN	O60494	3623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	NCR2	O95944	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADIRF	Q15847	76 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZUT4	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		H3BRN7	92 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	BCL2	P10415	239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	APOC4	P55056	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	LAGE3	Q14657	143 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q5XG85	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6AWC8	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1B0GWB2	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		J3QQQ9	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	FGF6	P10767	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAS2R45	P59539	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SERF2	P84101	59 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATR	Q13535	2644 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638		F5H697	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	MT-ND6	P03923	174 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	PFN2	P35080	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM258	P61165	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	SEC11A	P67812	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRR25	Q96S07	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECHDC1-208	ENST00000436638	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.59	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638		F8W1H4	67 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	ISLR	O14498	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRY	O14603	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRGC2	P03986	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	CTRL	P40313	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECHDC1-208	ENST00000436638	HERVK_113	P63121	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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