RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 FAM222AQ5U5X8 452 aa21.12■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 FAM104BQ5XKR9 115 aa21.12■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 DKK2Q9UBU2 259 aa21.12■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 CELA1Q9UNI1 258 aa21.12■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 TGP01266 2768 aa21.12■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM15Q7Z3B0 74 aa21.11■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1644Q3SXP7 199 aa21.11■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 SPXQ9BT56 116 aa21.1■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 STAB2Q8WWQ8 2551 aa21.1■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 C5orf52A6NGY3 159 aa21.09■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 SPART-AS1P0CW21 52 aa21.09■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 EDA2RQ9HAV5 297 aa21.09■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 LYRM9A8MSI8 78 aa21.08■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 M0R381 172 aa21.08■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFA6P56556 154 aa21.08■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 MUC4Q99102 2169 aa21.08■□□□□ 0.97
ECHS1-201ENST00000368547 SRIP30626 198 aa21.07■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 Q0VG73 95 aa21.07■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 OR10J3Q5JRS4 329 aa21.07■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZTI0 123 aa21.07■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 AMN1Q8IY45 258 aa21.07■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 SYT8Q8NBV8 401 aa21.07■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 PTH2Q96A98 100 aa21.07■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa21.06■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 M0R2P5 195 aa21.06■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 AP1S3Q96PC3 154 aa21.06■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa21.05■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB130BP0DP73 79 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB130AP0DP74 79 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 EVI2AP22794 236 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 LGALS9BQ3B8N2 356 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf45Q8TAV5 145 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 GAGE12BA1L429 117 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 GAGE7O76087 117 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 GAGE12FP0CL80 117 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 GAGE12GP0CL81 117 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 GAGE12IP0CL82 117 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 RAB4AP20338 218 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 RNF185Q96GF1 192 aa21.04■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 PPBPP02775 128 aa21.02■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 HOXA5P20719 270 aa21.02■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF876PQ49A33 203 aa21.02■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00612Q8N6U2 182 aa21.02■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 DPH3P1Q9H4G8 78 aa21.02■□□□□ 0.96
ECHS1-201ENST00000368547 DAD1P61803 113 aa21.01■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 RASL10AQ92737 203 aa21.01■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa21■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf74Q32Q52 190 aa21■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 ORMDL3Q8N138 153 aa21■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 C18orf32Q8TCD1 76 aa21■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFAF3Q9BU61 184 aa21■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa20.98■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 TRGV2A0A075B6R0 118 aa20.97■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 D6R8Y8 96 aa20.97■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 POM121L12Q8N7R1 296 aa20.97■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa20.97■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 CKS2P33552 79 aa20.96■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 MRAP2Q96G30 205 aa20.96■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM17P0DL12 118 aa20.96■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 BAGE3Q86Y29 109 aa20.96■□□□□ 0.95
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZTC4 211 aa20.95■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 PRELID3AQ96N28 172 aa20.95■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 ESDP10768 282 aa20.93■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 C18orf15Q96N68 181 aa20.93■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 HIST3H2BBQ8N257 126 aa20.93■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00315P59091 139 aa20.92■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 A8MWV9 139 aa20.91■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 JPT2Q9H910 190 aa20.91■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 NACAE9PAV3 2078 aa20.9■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 SERF1AO75920 110 aa20.89■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3-53P01767 116 aa20.89■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 CRYGDP07320 174 aa20.89■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00310P59036 64 aa20.89■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 IQCJQ1A5X6 159 aa20.89■□□□□ 0.94
ECHS1-201ENST00000368547 ATP5G1P05496 136 aa20.89■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP126Q5VTH2 177 aa20.89■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 OR4C5Q8NGB2 326 aa20.89■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV4A0A0B4J268 109 aa20.88■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 RS1O15537 224 aa20.88■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 NCR2O95944 276 aa20.88■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 HTN3P15516 51 aa20.88■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF479Q96JC4 524 aa20.88■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 SMKR1H3BMG3 65 aa20.87■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa20.87■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R17O96001 155 aa20.86■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 NPYP01303 97 aa20.86■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 MGPP08493 103 aa20.86■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 SAMD10Q9BYL1 202 aa20.86■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 A0A087WWL8 130 aa20.86■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 TNFRSF6BO95407 300 aa20.86■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 S100A2P29034 98 aa20.86■□□□□ 0.93
ECHS1-201ENST00000368547 NRACQ8N912 160 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.7 ms