RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 ESM1Q9NQ30 184 aa11.07□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.06□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.06□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 WFDC2Q14508 124 aa11.06□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 H3BUA1 57 aa11.06□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 BAALC-AS2P0C853 105 aa11.06□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCL24O00175 119 aa11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGHG4P01861 327 aa11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 EP400Q96L91 3159 aa11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 NCKAP5O14513 1909 aa11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 DSCR8Q96T75 97 aa11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGLV1-47P01700 117 aa11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 Q6ZPA2 131 aa11.05□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 PROP1O75360 226 aa11.04□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 B5MCH6 92 aa11.04□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 Q8N1Y9 231 aa11.04□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 Q8N7P7 452 aa11.04□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 APOC4P55056 127 aa11.04□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.04□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.04□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.03□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.03□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.03□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 Q9HAA7 133 aa11.03□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.03□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF503Q96F45 646 aa11.02□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.02□□□□□ -0.64
RPS6KC1-201ENST00000366959 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 J3QKU1 62 aa11.02□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 TAX1BP3O14907 124 aa11.02□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.02□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRSS47A8MTI9 375 aa11.02□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 MRAPQ8TCY5 172 aa11.02□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPRY4Q9C004 299 aa11.02□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa11.01□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.01□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.01□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.01□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 BRWD1-AS2P59051 145 aa11.01□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.01□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 A0A087WW49 117 aa11□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 hADV29S1A0JD25 119 aa11□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRBV12-3P01733 135 aa11□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 TANC2Q9HCD6 1990 aa11□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 GYPEP15421 78 aa10.99□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 BAALCQ8WXS3 180 aa10.99□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 FANCD2OSQ96PS1 177 aa10.99□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.99□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 C11orf86A6NJI1 115 aa10.99□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa10.99□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa10.98□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 CGB3P0DN86 165 aa10.98□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 TP73-AS1Q9UF72 201 aa10.98□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 C2orf16Q68DN1 1984 aa10.98□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRACP01848 142 aa10.98□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 JMJD1CQ15652 2540 aa10.98□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.98□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 C22orf34Q6ZV56 151 aa10.98□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 ODF1Q14990 250 aa10.97□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa10.97□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.97□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 MDFICQ9P1T7 246 aa10.97□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 PIFOQ8TCI5 191 aa10.97□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.97□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.97□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 ORMDL1Q9P0S3 153 aa10.97□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 CGB7P0DN87 165 aa10.96□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 CTRLP40313 264 aa10.96□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 PTH2Q96A98 100 aa10.96□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 CITED1Q99966 193 aa10.96□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.96□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 P0C879 139 aa10.96□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 DENND4AQ7Z401 1863 aa10.96□□□□□ -0.65
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa10.96□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 C2orf70A6NJV1 201 aa10.96□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 LINC01620Q4KN68 170 aa10.96□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 CRIP3Q6Q6R5 217 aa10.96□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.96□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa10.96□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 LINC01548A6NM66 108 aa10.95□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 DEFB4AO15263 64 aa10.95□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 GDF5OSQ5U4N7 250 aa10.95□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RPS6KC1-201ENST00000366959 K7EQD1 137 aa10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms