RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 PLNP26678 52 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 NEGR1Q7Z3B1 354 aa15.37■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A087WWL8 130 aa15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 H7C1H1 209 aa15.36■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa15.35■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 BAALCQ8WXS3 180 aa15.35■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 TEX15Q9BXT5 2789 aa15.34■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.34■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 A6NDN8 102 aa15.34■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 A8MTW9 85 aa15.34■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 CHAC1Q9BUX1 264 aa15.34■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 SORL1Q92673 2214 aa15.33■□□□□ 0.05
KCNQ1-202ENST00000335475 H3BRM9 83 aa15.33■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 RBMY1CP0DJD4 496 aa15.33■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa15.32■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC01619G3V211 115 aa15.32■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.32■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 C4orf3Q8WVX3 66 aa15.32■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 CRYGDP07320 174 aa15.32■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa15.32■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SYT8Q8NBV8 401 aa15.31■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 KNCNA6PVL3 124 aa15.31■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFP2Q6ZN57 461 aa15.31■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 APCP25054 2843 aa15.3■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TSHBP01222 138 aa15.3■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM74A4Q5TZK3 123 aa15.3■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 OR11H1Q8NG94 326 aa15.3■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 JMJD8Q96S16 334 aa15.3■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 CYSLTR1Q9Y271 337 aa15.3■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAV2A0A0B4J234 112 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SDHAF1A6NFY7 115 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 F5H697 171 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4C5Q8NGB2 326 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 DUX3Q96PT4 197 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 C9orf118A6NHY6 69 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 M0QY20 66 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 VCYO14598 125 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 RIPPLY3P57055 190 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 DEFB131AP59861 70 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa15.29■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 IGIPA6NJ69 53 aa15.28■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 FXYD2P54710 66 aa15.28■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM61Q8N0U2 210 aa15.28■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM86BQ8N661 226 aa15.28■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TRGV11A0A075B6L2 103 aa15.28■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 K7EP13 123 aa15.28■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.27■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 H3BMM0 161 aa15.27■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.27■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 PEMTQ9UBM1 199 aa15.27■□□□□ 0.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF56Q15929 161 aa15.26■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 KIR2DL4Q99706 377 aa15.26■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 AKAP9Q99996 3911 aa15.26■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC01549A6NIU2 74 aa15.26■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 Q6ZSV7 163 aa15.26■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa15.26■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 GCSHP23434 173 aa15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 RPL39P62891 51 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 RBX1P62877 108 aa15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF876PQ49A33 203 aa15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TIMM17AQ99595 171 aa15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TM2D2Q9BX73 214 aa15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 ITPR3Q14573 2671 aa15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 H3BUT2 72 aa15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 CEND1Q8N111 149 aa15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 E9PLD3 99 aa15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP6D1Q9H9H5 199 aa15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.22■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 OR11H12B2RN74 326 aa15.22■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.22■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 OR11H2Q8NH07 326 aa15.22■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa15.22■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM141Q96I45 108 aa15.22■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.21■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB37Q96AX2 223 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.4 ms