RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CLUHP3Q96NS8 147 aa16.66■□□□□ 0.26
VSTM4-201ENST00000298454 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
VSTM4-201ENST00000298454 XCL2Q9UBD3 114 aa16.65■□□□□ 0.26
VSTM4-201ENST00000298454 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
VSTM4-201ENST00000298454 TCAPO15273 167 aa16.64■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF876PQ49A33 203 aa16.64■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00482Q8N8I6 264 aa16.64■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 INSP01308 110 aa16.64■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 FAM74A4Q5TZK3 123 aa16.64■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 PET117Q6UWS5 81 aa16.64■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 LINC01587Q99440 93 aa16.64■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 WFDC10AQ9H1F0 79 aa16.64■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA45Q537H7 98 aa16.63■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 C20orf144Q9BQM9 153 aa16.63■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 FCER1GP30273 86 aa16.62■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.62■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.62■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.62■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 PMCHL2Q9BQD1 86 aa16.62■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 F5H697 171 aa16.61■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 CRYGDP07320 174 aa16.61■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM158Q8WZ71 300 aa16.61■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 C20orf78Q9BR46 151 aa16.61■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 C19orf73Q9NVV2 129 aa16.61■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 C20orf202A1L168 122 aa16.61■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 LAGE3Q14657 143 aa16.6■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 C18orf15Q96N68 181 aa16.6■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 DEFA6Q01524 100 aa16.59■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 LINC01545Q5VT33 79 aa16.59■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA3Q8NHX4 192 aa16.59■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa16.58■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 IFI27L1Q96BM0 104 aa16.58■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.58■□□□□ 0.25
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf158Q8N1D5 194 aa16.58■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 C14orf144Q96I85 54 aa16.58■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa16.57■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R17O96001 155 aa16.57■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF415Q09FC8 603 aa16.57■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF56Q15929 161 aa16.57■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf72Q8NBR9 251 aa16.57■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFAF3Q9BU61 184 aa16.57■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 FAM110AQ9BQ89 295 aa16.57■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM208Q9BTX3 173 aa16.57■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 CSTL1Q9H114 145 aa16.56■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 IGLL1P15814 213 aa16.55■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 AZU1P20160 251 aa16.55■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.55■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 hDV102S1A0JD36 115 aa16.55■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 M0R2P5 195 aa16.55■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 F8P00451 2351 aa16.55■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT3O95989 172 aa16.54■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 MIEN1Q9BRT3 115 aa16.54■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 ST20Q9HBF5 79 aa16.54■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 TENM1Q9UKZ4 2725 aa16.54■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 JMJD1CQ15652 2540 aa16.54■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 CITED1Q99966 193 aa16.54■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 M0QY20 66 aa16.53■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa16.52■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16.52■□□□□ 0.24
VSTM4-201ENST00000298454 IGLC3P0DOY3 106 aa16.51■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 LGALS9BQ3B8N2 356 aa16.51■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 ORMDL2Q53FV1 153 aa16.51■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 LGALS9CQ6DKI2 356 aa16.51■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 VWFP04275 2813 aa16.5■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.49■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 K7EMI3 77 aa16.49■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa16.49■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa16.48■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 RPL32P62910 135 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 PTH2Q96A98 100 aa16.48■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 SPXQ9BT56 116 aa16.48■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 A8MWV9 139 aa16.48■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS1P07477 247 aa16.48■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa16.48■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 UFSP1Q6NVU6 142 aa16.48■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 DKK2Q9UBU2 259 aa16.48■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 VCYO14598 125 aa16.47■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 ATP5LO75964 103 aa16.47■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP126Q5VTH2 177 aa16.47■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 UQCR10Q9UDW1 63 aa16.47■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 HSBP1L1C9JCN9 74 aa16.46■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.46■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 TOMM6Q96B49 74 aa16.46■□□□□ 0.23
VSTM4-201ENST00000298454 INSL3P51460 131 aa16.45■□□□□ 0.22
VSTM4-201ENST00000298454 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa16.45■□□□□ 0.22
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf66Q6UXQ4 117 aa16.45■□□□□ 0.22
VSTM4-201ENST00000298454 IL17DQ8TAD2 202 aa16.45■□□□□ 0.22
VSTM4-201ENST00000298454 ODF1Q14990 250 aa16.44■□□□□ 0.22
VSTM4-201ENST00000298454 ATRQ13535 2644 aa16.44■□□□□ 0.22
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