RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 BICRAQ9NZM4 1560 aa0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 IGLC6P0CF74 106 aa0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC25A6P12236 298 aa0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 RPL37P61927 97 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 MIC13Q5XKP0 118 aa0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 C10orf99Q6UWK7 81 aa0.36□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 DYNLRB2Q8TF09 96 aa0.36□□□□□ -2.35
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SPTAN1-232ENST00000636483 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 TENM3Q9P273 2699 aa0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa0.35□□□□□ -2.35
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SPTAN1-232ENST00000636483 LINC00694P0DN24 101 aa0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 FXYD6P3P58550 94 aa0.35□□□□□ -2.35
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SPTAN1-232ENST00000636483 KLKP1Q107X0 134 aa0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 SMIM21Q3B7S5 101 aa0.35□□□□□ -2.35
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SPTAN1-232ENST00000636483 SPANXCQ9NY87 97 aa0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 ADGRB1O14514 1584 aa0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.35□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.34□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 SPEF2Q9C093 1822 aa0.34□□□□□ -2.35
SPTAN1-232ENST00000636483 DISP2A7MBM2 1401 aa0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 PHLPP1O60346 1717 aa0.34□□□□□ -2.36
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SPTAN1-232ENST00000636483 NPC2P61916 151 aa0.34□□□□□ -2.36
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SPTAN1-232ENST00000636483 MYOM3Q5VTT5 1437 aa0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 CTAGE3PQ8IX95 158 aa0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 IFI27L1Q96BM0 104 aa0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM141Q96I45 108 aa0.34□□□□□ -2.36
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SPTAN1-232ENST00000636483 COPZ2Q9P299 210 aa0.34□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 SPTBP11277 2137 aa0.34□□□□□ -2.36
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SPTAN1-232ENST00000636483 MYH13Q9UKX3 1938 aa0.33□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa0.33□□□□□ -2.36
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SPTAN1-232ENST00000636483 LAMB1P07942 1786 aa0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 PHIPQ8WWQ0 1821 aa0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 MYH6P13533 1939 aa0.31□□□□□ -2.36
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SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 COX4I1P13073 169 aa0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 C20orf197Q8N268 126 aa0.31□□□□□ -2.36
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SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.31□□□□□ -2.36
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SPTAN1-232ENST00000636483 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 A0A096LNT2 108 aa0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 PIRTP0C851 137 aa0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 CCL3L1P16619 93 aa0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 RPS25P62851 125 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 S100A7L2Q5SY68 101 aa0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC48A1Q6P1K1 146 aa0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 SMR3AQ99954 134 aa0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 VPS25Q9BRG1 176 aa0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM107BQ9H098 131 aa0.3□□□□□ -2.36
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