RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 FOXI1Q12951 378 aa3.15□□□□□ -1.9
ANKRD28-215ENST00000624145 DEFB113Q30KQ7 82 aa3.15□□□□□ -1.9
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ANKRD28-215ENST00000624145 CSRP3P50461 194 aa3.15□□□□□ -1.9
ANKRD28-215ENST00000624145 DEFB135Q30KP9 77 aa3.15□□□□□ -1.9
ANKRD28-215ENST00000624145 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.15□□□□□ -1.9
ANKRD28-215ENST00000624145 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.15□□□□□ -1.9
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ANKRD28-215ENST00000624145 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.15□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 DOCK5Q9H7D0 1870 aa3.15□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF726P1Q15940 193 aa3.14□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 LINC00643Q86TS7 51 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.14□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 C11orf86A6NJI1 115 aa3.14□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 RETNQ9HD89 108 aa3.14□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 UBE2D3P61077 147 aa3.14□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 SEC16AO15027 2179 aa3.14□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 C20orf197Q8N268 126 aa3.14□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 IGFL3Q6UXB1 125 aa3.13□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF236Q9UL36 1845 aa3.13□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 C15orf65H3BRN8 121 aa3.13□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 INSL3P51460 131 aa3.13□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 CHD5Q8TDI0 1954 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 IGHV2-70P01814 119 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 RPL39P62891 51 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 E9PLD3 99 aa3.13□□□□□ -1.91
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ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 ATAD5Q96QE3 1844 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 CRYGDP07320 174 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 HILS1P60008 231 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 C2orf70A6NJV1 201 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 C1orf195Q5TG92 126 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 SCXQ7RTU7 201 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 LOC285556D6RIA3 1793 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 G3V4G9 280 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 MPDZO75970 2070 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-215ENST00000624145 UQCRQO14949 82 aa3.12□□□□□ -1.91
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