RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587878.1

ATP9B-211, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), humanhuman

TSL 3

Gene ATP9B, Length 344 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9B-211ENST00000587878 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 CCL16O15467 120 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 IGKV1-16P04430 117 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 CXCL1P09341 107 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 IGLC6P0CF74 106 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 LINC00694P0DN24 101 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 RPL22P35268 128 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 RBP2P50120 134 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 DYNLT3P51808 116 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 TMBIM6P55061 237 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 KRTAP12-2P59991 146 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 HBBP68871 147 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 ZNF90Q03938 601 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 OSTCQ9NRP0 149 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 ANK1P16157 1881 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 STAB1Q9NY15 2570 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 MYH10P35580 1976 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 COL1A2P08123 1366 aa3□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 F6UZH7 168 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 H3BMG7 143 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 H3BT86 120 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 MAXP61244 160 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 RHOGP84095 191 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 KISS1Q15726 138 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 C22orf39Q6P5X5 142 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 CTAGE3PQ8IX95 158 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 MMGT1Q8N4V1 131 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 GINS4Q9BRT9 223 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 PDCD10Q9BUL8 212 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 NDUFB11Q9NX14 153 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 DENND4CQ5VZ89 1909 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 ACANP16112 2415 aa2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 A0A1W2PNN7 141 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 E7EQL1 145 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 H7C2G1 150 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 NCR2O95944 276 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 S100A8P05109 93 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 ARPP19P56211 112 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 BRK1Q8WUW1 75 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 PPP3R2Q96LZ3 170 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa2.98□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 ODF3BA8MYP8 253 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 CORTO00230 105 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 NPFFO15130 113 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 RAB5CP51148 216 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 FXYD2P54710 66 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 TEX29Q8N6K0 151 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 NAT14Q8WUY8 206 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 TAF9BQ9HBM6 251 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 EPDR1Q9UM22 224 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 MYOFQ9NZM1 2061 aa2.97□□□□□ -1.93
ATP9B-211ENST00000587878 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 C20orf202A1L168 122 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 NDUFB3O43676 98 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 HIST1H2BKO60814 126 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 TCL1BO95988 128 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 IFNA4P05014 189 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 HIST1H2BJP06899 126 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 ZNF181Q2M3W8 571 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 OR5A2Q8NGI9 324 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 PFN4Q8NHR9 129 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 Q9BRP9 147 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 NPCDR1Q9BY65 106 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 COL6A5A8TX70 2615 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 NOTCH1P46531 2555 aa2.96□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 RP1P56715 2156 aa2.95□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 OBSL1O75147 1896 aa2.95□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.95□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 ZNF727A8MUV8 499 aa2.95□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 C3orf84H3BNL1 204 aa2.95□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 CRYGSP22914 178 aa2.95□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 AQP4P55087 323 aa2.95□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 TMEM258P61165 79 aa2.95□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 QRFPP83859 136 aa2.95□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 ERHP84090 104 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
ATP9B-211ENST00000587878 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.3 ms