RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 KRTDAPP60985 99 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 PRELID3AQ96N28 172 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 MDFICQ9P1T7 246 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 OR5AL1P0C617 328 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 HLA-DRB4P13762 266 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 Q6ZWC4 215 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 ORMDL3Q8N138 153 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 Q8N1Y9 231 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 XCL2Q9UBD3 114 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 OR11H12B2RN74 326 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 LINC00614P0C842 121 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 RAB4AP20338 218 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 AMTNQ6UX39 209 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 JPT2Q9H910 190 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 CBY3A6NI87 242 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 NPYP01303 97 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 MGPP08493 103 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 STHQ8IWL8 128 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 CNFNQ9BYD5 112 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 H0Y8G0 127 aa6.21□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.21□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.21□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.21□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.21□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 A0A087WWL8 130 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 RNF185Q96GF1 192 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 SNAI2O43623 268 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 FA2HQ7L5A8 372 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 ESDP10768 282 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 LINC01587Q99440 93 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 F5H697 171 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 IGLV1-51P01701 117 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 MUC4Q99102 2169 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 TNFRSF6BO95407 300 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 CACNG7P62955 275 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 ODF3Q96PU9 254 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 SMIM17P0DL12 118 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 GATD1Q8NB37 220 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 PRO1933Q9H354 126 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 TDRG1Q3Y452 100 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 ZNF876PQ49A33 203 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 ATOH7Q8N100 152 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 AP1S3Q96PC3 154 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 LEPROTL1O95214 131 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 C3orf79P0CE67 100 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 S100A12P80511 92 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 NACAE9PAV3 2078 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 PPBPP02775 128 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 DEFB125Q8N687 156 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 U3KQK5 164 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 TCAPO15273 167 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 INSP01308 110 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 C18orf15Q96N68 181 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 NOTCH1P46531 2555 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-215ENST00000549143 AZU1P20160 251 aa6.16□□□□□ -1.42
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