RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515564.5

GATB-212, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, humanhuman

TSL 2

Gene GATB, Length 6,552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATB-212ENST00000515564 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.45□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 C14orf177Q52M58 125 aa6.45□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 CFPP27918 469 aa6.45□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.45□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 C20orf78Q9BR46 151 aa6.45□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 I3L2K1 104 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 NDUFA1O15239 70 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 NPYP01303 97 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 POU2AF1Q16633 256 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 PRO3102Q9H379 93 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 K7EMT4 169 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 LYL1P12980 280 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 CTSGP08311 255 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.44□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 MORN5Q5VZ52 161 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 NCKAP5O14513 1909 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 NOTCH4Q99466 2003 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 K7EIM0 57 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 Q9H8V8 135 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 TRBV12-3P01733 135 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 M0R2N4 97 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 IGHG4P01861 327 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 Q8N1Y9 231 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 UBL5Q9BZL1 73 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.43□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 COLCA2A8K830 154 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 NCR3O14931 201 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 IGLV3-1P01715 115 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 KIR3DS1Q14943 382 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 LTAP01374 205 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 LMO4P61968 165 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 Q0VG73 95 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.42□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 B9D2Q9BPU9 175 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 J3QQQ9 107 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 CRYGDP07320 174 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 PRO0255Q9UI72 69 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 HERV-K104P63124 156 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 ZNF726P1Q15940 193 aa6.41□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 TMEM131Q92545 1883 aa6.4□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 A8MWP6 167 aa6.4□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 DEFB1P60022 68 aa6.4□□□□□ -1.38
GATB-212ENST00000515564 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.4□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 COX7B2Q8TF08 81 aa6.4□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 NDUFB1O75438 58 aa6.4□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.4□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 FGF6P10767 208 aa6.4□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.4□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.4□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 Q6ZSV7 163 aa6.4□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.4□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 ROS1P08922 2347 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 SPAG11BQ08648 103 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 V9GYV3 84 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 MPV17L2Q567V2 206 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 PRR20EP86478 221 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 PRR20CP86479 221 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 PRR20DP86480 221 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 PRR20BP86481 221 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 PRR20AP86496 221 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 GTF3C1Q12789 2109 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 F8VRH5 84 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 SIGMAR1Q99720 223 aa6.39□□□□□ -1.39
GATB-212ENST00000515564 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.38□□□□□ -1.39
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