RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 TNFRSF6BO95407 300 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 LEPP41159 167 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.74□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 H3BVH4 76 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 H3BUA1 57 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 TGFAP01135 160 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.855e-14■■□□□ 12.5
PRAME-213ENST00000492657 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 APCP25054 2843 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 INSL3P51460 131 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 CFHR3Q02985 330 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 WFDC2Q14508 124 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 CIDEAO60543 219 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 PRSS1P07477 247 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP10-9P60411 292 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 DPF1Q92782 380 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.71□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 A0A096LNT2 108 aa9.71□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 FABP2P12104 132 aa9.71□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 SFTA2Q6UW10 78 aa9.71□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.71□□□□□ -0.85
PRAME-213ENST00000492657 BRI3O95415 125 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 HSD52Q0P140 79 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 NF1P21359 2839 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 ODF1Q14990 250 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 LINC00477Q96M19 166 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 RNF223E7ERA6 249 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 H3BMG7 143 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 ETDBQ3ZM63 59 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 DSCR9P59020 149 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 SMPXQ9UHP9 88 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 OVOL1O14753 267 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A16P16260 332 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 FCER1GP30273 86 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 TMEM158Q8WZ71 300 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 MUC4Q99102 2169 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 M0R381 172 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 GNRH2O43555 120 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 COX6B1P14854 86 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 PSMB8P28062 276 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 GATA3P23771 443 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 NRACQ8N912 160 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 FOXC2Q99958 501 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 CR1P17927 2039 aa9.68□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 SMIM13P0DJ93 91 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 ITPR3Q14573 2671 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 ZNF843Q8N446 348 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 Q8N8P6 123 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 DUX5Q96PT3 197 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 LINC01546A6NGU7 62 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 SIVA1O15304 175 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 SMIM17P0DL12 118 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 TMEM160Q9NX00 188 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 IGKCP01834 107 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-213ENST00000492657 CHD6Q8TD26 2715 aa9.65□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 DCANP1Q8TF63 244 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 SIGMAR1Q99720 223 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 IGKV3-20P01619 116 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 ZNF688P0C7X2 276 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 ASIPP42127 132 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 TENM4Q6N022 2769 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 K7EMT4 169 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-213ENST00000492657 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.63□□□□□ -0.87
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