RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 RNF185Q96GF1 192 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 Q96MF0 132 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 DYNLRB1Q9NP97 96 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.52□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 A0A0J9YY99 117 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 ZNF815PA8K554 130 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 PATE4P0C8F1 98 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZQT7 251 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 WDR86Q86TI4 376 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 FDCSPQ8NFU4 85 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TOMM6Q96B49 74 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 DPH3Q96FX2 82 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.51□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 PSMB8P28062 276 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SSR4P51571 173 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 IGFL3Q6UXB1 125 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 COPS9Q8WXC6 57 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 PROK2Q9HC23 129 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.5□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 COL6A6A6NMZ7 2263 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 MGAQ8IWI9 3026 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 C11orf86A6NJI1 115 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 M0R381 172 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 WNT9BO14905 357 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 CRIP1P50238 77 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 CCL8P80075 99 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 LCE3BQ5TA77 95 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 DAND5Q8N907 189 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 UBALD1Q8TB05 177 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 METTL26Q96S19 204 aa5.49□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 ATRXP46100 2492 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 CXCL13O43927 109 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 BCE1O60756 84 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 NDUFC2O95298 119 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 PRDX2P32119 198 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 ZNF56Q15929 161 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TMEM155Q4W5P6 130 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 C2orf82Q6UX34 121 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 C2orf48Q96LS8 159 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SIRPDQ9H106 197 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SPTA1P02549 2419 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 DNAJC13O75165 2243 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.48□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 RBAKDNA6NC62 111 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 OOSP1A8MZH6 123 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 EPM2AB3EWF7 344 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SRRM5B3KS81 715 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SH2D1AO60880 128 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 ERCC8Q13216 396 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 MDS2Q8NDY4 140 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 TMEM141Q96I45 108 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 SVILO95425 2214 aa5.47□□□□□ -1.53
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 H3BRN7 92 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 NDUFA3O95167 84 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-13P01766 116 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 EFNA4P52798 201 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 SPINK14Q6IE38 97 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 ZGRF1Q86YA3 2104 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 LINC00311Q8N616 119 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 SERP2Q8N6R1 65 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 NRACQ8N912 160 aa5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PKP4-211ENST00000481115 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms