RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	FABP5	Q01469	135 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM17-208	ENST00000467080	CATR1	Q13166	79 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM17-208	ENST00000467080	IDNK	Q5T6J7	187 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM17-208	ENST00000467080	HACD4	Q5VWC8	232 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM17-208	ENST00000467080	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM17-208	ENST00000467080	OR4X1	Q8NH49	305 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM17-208	ENST00000467080	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM17-208	ENST00000467080	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM17-208	ENST00000467080	PRND	Q9UKY0	176 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	LECT2	O14960	151 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	IGKV1-5	P01602	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	CTXN2	P0C2S0	81 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	TSPO	P30536	169 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	PRSS3	P35030	304 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	OPRK1	P41145	380 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ARPC4	P59998	168 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	MSMO1	Q15800	293 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080		Q6ZTI0	123 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	RNF182	Q8N6D2	247 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	CYGB	Q8WWM9	190 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	VCX3B	Q9H321	246 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	DOK5	Q9P104	306 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	IRGM	A1A4Y4	181 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	HLA-DQA1	P01909	254 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	OR10J1	P30954	320 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ETV6	P41212	452 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	PSMB3	P49720	205 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	PSMB2	P49721	201 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	GNG2	P59768	71 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	SSX1	Q16384	188 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	BSX	Q3C1V8	233 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080		Q5W150	140 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	LINC01587	Q99440	93 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	IFITM5	A6NNB3	132 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV3-53	P01767	116 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	C1QB	P02746	253 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF90	Q03938	601 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	SLC35G3	Q8N808	338 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080		Q8WTZ3	238 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ACY3	Q96HD9	319 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080		H3BNG1	76 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ISLR	O14498	428 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	NDUFS5	O43920	106 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	PMP2	P02689	132 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	SNCA	P37840	140 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	HSPA13	P48723	471 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	OR2F1	Q13607	317 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF738	Q8NE65	137 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	MND1	Q9BWT6	205 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	RPRM	Q9NS64	109 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1B0GVG6	124 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF98	A6NK75	572 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	GPR31	O00270	319 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	PSCA	O43653	123 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	MED6	O75586	246 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	ARL6IP5	O75915	188 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	CRYGD	P07320	174 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	RD3L	P0DJH9	198 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	KRTAP10-10	P60014	251 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	RHOB	P62745	196 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBM17-208	ENST00000467080	TP53RK	Q96S44	253 aa		3.04	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.9 ms