RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 SMIM12Q96EX1 92 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 DERL1Q9BUN8 251 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 TPPP3Q9BW30 176 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 IL36BQ9NZH7 164 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 H3BNG1 76 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 M0R381 172 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 SMIM17P0DL12 118 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 SRIP30626 198 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 CRIP1P50238 77 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 SSTP61278 116 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 LINC01559Q495D7 138 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 ZFP82Q8N141 532 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 ZNF479Q96JC4 524 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-208ENST00000462335 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 TMEM250H0YL14 139 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 GYPEP15421 78 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 C9orf85Q96MD7 179 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 ZNF727A8MUV8 499 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 M0R2N4 97 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 RHODO00212 210 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 RS1O15537 224 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 CRYBA4P53673 196 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 FHL2Q14192 279 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 PTH2Q96A98 100 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 FAM210AQ96ND0 272 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 MLST8Q9BVC4 326 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 MUC4Q99102 2169 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 A0A096LPF7 62 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 F5H697 171 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 RHOHQ15669 191 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 BORCS7Q96B45 105 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 PARLQ9H300 379 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 F2Z2F3 143 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 CXCL1P09341 107 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 MED14OSP0DP75 135 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 ERVFC1-1P60608 527 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 DNLZQ5SXM8 178 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 OCC1Q8TAD7 63 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 A0A087WWL8 130 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 A0A1W2PPQ1 181 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 CACNG7P62955 275 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 NUDT11Q96G61 164 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 K7EQD1 137 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 OR5AL1P0C617 328 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 GZMBP10144 247 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 ZNF56Q15929 161 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 ESRGQ1W209 222 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 TTC32Q5I0X7 151 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 SFRP2Q96HF1 295 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 Q9H8V8 135 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 A8MWL6 223 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 IGLV2-8P01709 118 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 MGPP08493 103 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-208ENST00000462335 TRGC1P0CF51 173 aa6.65□□□□□ -1.34
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