RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 H3BUT2 72 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 SMPXQ9UHP9 88 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 FXYD2P54710 66 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 RBX1P62877 108 aa11.69□□□□□ -0.54
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NISCH-202ENST00000420808 DCANP1Q8TF63 244 aa11.68□□□□□ -0.54
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NISCH-202ENST00000420808 K7ERJ3 54 aa11.68□□□□□ -0.54
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NISCH-202ENST00000420808 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-202ENST00000420808 B4DSR2 109 aa11.67□□□□□ -0.54
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NISCH-202ENST00000420808 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.545e-7■■■■□ 23
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NISCH-202ENST00000420808 PSMB8P28062 276 aa11.66□□□□□ -0.54
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NISCH-202ENST00000420808 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.66□□□□□ -0.54
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NISCH-202ENST00000420808 A0A0G2JLM5 398 aa11.65□□□□□ -0.54
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NISCH-202ENST00000420808 A0A087WX48 190 aa11.65□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 LINC00315P59091 139 aa11.65□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 RNF151Q2KHN1 245 aa11.65□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.65□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 C9orf118A6NHY6 69 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 SIVA1O15304 175 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 BRI3O95415 125 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 PSMG4Q5JS54 123 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 KLLNB2CW77 178 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 CST9LQ9H4G1 147 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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NISCH-202ENST00000420808 A0A096LNT2 108 aa11.63□□□□□ -0.55
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NISCH-202ENST00000420808 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 H3BRM9 83 aa11.63□□□□□ -0.55
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NISCH-202ENST00000420808 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 CD7P09564 240 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 CSTL1Q9H114 145 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.63□□□□□ -0.55
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NISCH-202ENST00000420808 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 C18orf65Q6ZTR6 163 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 MDFICQ9P1T7 246 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.62□□□□□ -0.552e-6■□□□□ 11.3
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NISCH-202ENST00000420808 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 AP1S3Q96PC3 154 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 BAALCQ8WXS3 180 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
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NISCH-202ENST00000420808 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.6□□□□□ -0.55
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NISCH-202ENST00000420808 PRM2P04554 102 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.6□□□□□ -0.55
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NISCH-202ENST00000420808 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
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NISCH-202ENST00000420808 F8VRH5 84 aa11.59□□□□□ -0.55
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NISCH-202ENST00000420808 CR1P17927 2039 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 K7EMT4 169 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 TSHBP01222 138 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 C20orf78Q9BR46 151 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-202ENST00000420808 H7C1H1 209 aa11.58□□□□□ -0.56
NISCH-202ENST00000420808 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.58□□□□□ -0.56
NISCH-202ENST00000420808 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
NISCH-202ENST00000420808 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.58□□□□□ -0.56
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