RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023		A0A0B4J2C4	111 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	RNF223	E7ERA6	249 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	VCY	O14598	125 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023		Q5PR19	223 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	IGIP	A6NJ69	53 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	CFC1B	P0CG36	223 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	CFC1	P0CG37	223 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	SRD5A1	P18405	259 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	GAGE5	Q13069	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	GAGE6	Q13070	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023		Q6Q795	121 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	ATP6V0E1	O15342	81 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	SLC25A20	O43772	301 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	IGHV1-69	P01742	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	CRYGD	P07320	174 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	FHL3	Q13643	280 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	GPHB5	Q86YW7	130 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023		J3QQQ9	107 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	SNCG	O76070	127 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF876P	Q49A33	203 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	PRR9	Q5T870	116 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023		Q8NA96	180 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	CITED1	Q99966	193 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	MGA	Q8IWI9	3026 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023		A0A0J9YX75	114 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	LEPROT	O15243	131 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	UBE2E1	P51965	193 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	RHOH	Q15669	191 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	ATXN8	Q156A1	80 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	AKAP13	Q12802	2813 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	RHOD	O00212	210 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	NDUFA4	O00483	81 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	ARL3	P36405	182 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	NBL1	P41271	181 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	PTH2	Q96A98	100 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	RNF183	Q96D59	192 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	TSHB	P01222	138 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	GAGE2B	Q13066	116 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	GAGE2E	Q4V326	116 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	SIRPD	Q9H106	197 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	SOCS3	O14543	225 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	IGHV3-33	P01772	117 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PPARG-208	ENST00000397023	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023		C9JAW5	83 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	BRI3	O95415	125 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	C20orf173	Q96LM9	149 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	AMELX	Q99217	191 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	CEP250	Q9BV73	2442 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	BSN	Q9UPA5	3926 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023		H3BUA1	57 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	LGALS9	O00182	355 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	SFTA2	Q6UW10	78 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	LINC01560	Q8TB33	94 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	ROS1	P08922	2347 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM223	A0PJW6	202 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023		A4D1N5	150 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023		M0R2P5	195 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	LINC00315	P59091	139 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PPARG-208	ENST00000397023	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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