RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 DR1Q01658 176 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 M0R2P5 195 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 CLLU1Q5K131 121 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNX29P2Q8IUI4 249 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 PYDC1Q8WXC3 89 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 IFI27L1Q96BM0 104 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 ERG28Q9UKR5 140 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYLKQ15746 1914 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPTBP11277 2137 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPAG17Q6Q759 2223 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 FANCMQ8IYD8 2048 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 PIEZO1Q92508 2521 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 RBAKDNA6NC62 111 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC179H3BU77 68 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 AIF1LQ9BQI0 150 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRR15LQ9BU68 103 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC171Q6TFL3 1326 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 UBR2Q8IWV8 1755 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A087WTM6 91 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPINK1P00995 79 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 Q5BKY6 102 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 AKAP14Q86UN6 197 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 MMGT1Q8N4V1 131 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 F2Z2F3 143 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 J3QLW9 94 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCL3L1P16619 93 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 NCS1P62166 190 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 BPESC1Q9GZL8 116 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 SAR1AQ9NR31 198 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 PBRM1Q86U86 1689 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAST4O15021 2626 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 IGLC6P0CF74 106 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 NPC2P61916 151 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYH2Q9UKX2 1941 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP54Q70EL1 1684 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 WDR97A6NE52 1622 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 LINC01545Q5VT33 79 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 C4orf33Q8N1A6 199 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 BATF3Q9NR55 127 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 NDUFA12Q9UI09 145 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 PTPRDP23468 1912 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUP210LQ5VU65 1888 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 ABCA12Q86UK0 2595 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 TSPAN19P0C672 248 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 CKS1BP61024 79 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 C20orf197Q8N268 126 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 COX7B2Q8TF08 81 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 Q96NJ1 140 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 LOC285556D6RIA3 1793 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 COX4I1P13073 169 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPCS2Q15005 226 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.03□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 SOGA1O94964 1423 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 TTC28Q96AY4 2481 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 NEBP20929 6669 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 TANC2Q9HCD6 1990 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRP5O75197 1615 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 ABCA4P78363 2273 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 ARPC5O15511 151 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 PITX3O75364 302 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 LINC00694P0DN24 101 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 COX6A2Q02221 97 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 V9GYV3 84 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYH3P11055 1940 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 PIRTP0C851 137 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM242Q9NWH2 141 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 GSKIPQ9P0R6 139 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-190P-201ENST00000384154 DISP2A7MBM2 1401 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms