RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362985.1

RNU6-490P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 490, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-490P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-490P-201ENST00000362985 IFNA6P05013 189 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 HIST1H2BJP06899 126 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 C8GP07360 202 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 TMED1Q13445 227 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 CST9Q5W186 159 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 OR2T2Q6IF00 324 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 FAM151BQ6UXP7 276 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 COPS6Q7L5N1 327 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 MT1MQ8N339 61 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 ANKRD29Q8N6D5 301 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 OR5A2Q8NGI9 324 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 BRK1Q8WUW1 75 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 MT1LQ93083 61 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 USMG5Q96IX5 58 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 PARVBQ9HBI1 364 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 COMMD3Q9UBI1 195 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 ERG28Q9UKR5 140 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 FGD6Q6ZV73 1430 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 UBR2Q8IWV8 1755 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 TMEM210A6NLX4 147 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 EVPLLA8MZ36 301 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 TAX1BP3O14907 124 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 RER1O15258 196 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 IGKCP01834 107 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 APOEP02649 317 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 TTRP02766 147 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 MT2AP02795 61 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 OCM2P0CE71 109 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SMIM6P0DI80 62 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 FABP4P15090 132 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 RPL12P30050 165 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 HADHBP55084 474 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 FADDQ13158 208 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SFXN4Q6P4A7 337 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 ALKAL1Q6UXT8 129 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 BAGE3Q86Y29 109 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 PIGXQ8TBF5 258 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SMIM4Q8WVI0 70 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 DNAJB3Q8WWF6 145 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SLC35B4Q969S0 331 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 BORCS7Q96B45 105 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 KCTD7Q96MP8 289 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SCN3BQ9NY72 215 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 GLTPQ9NZD2 209 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 C9orf84Q5VXU9 1444 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 DOCK5Q9H7D0 1870 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 USP54Q70EL1 1684 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 CEP164Q9UPV0 1460 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 J3KT08 172 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 CALUO43852 315 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SSSCA1O60232 199 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 DCTN3O75935 186 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 IFNA7P01567 189 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 TPM2P07951 284 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SERPINA6P08185 405 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 CCDC172P0C7W6 258 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 RPL35P42766 123 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 RSU1Q15404 277 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 C1orf195Q5TG92 126 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SCIMPQ6UWF3 145 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 IFT20Q8IY31 132 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 DIRC1Q969H9 104 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 SMIM7Q9BQ49 75 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 DRC3Q9H069 523 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 OR52A5Q9H2C5 316 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 TRIOO75962 3097 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.1□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.58
RNU6-490P-201ENST00000362985 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-490P-201ENST00000362985 RAD50Q92878 1312 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-490P-201ENST00000362985 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-490P-201ENST00000362985 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-490P-201ENST00000362985 PXDNQ92626 1479 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-490P-201ENST00000362985 KIAA0556O60303 1618 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-490P-201ENST00000362985 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-490P-201ENST00000362985 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-490P-201ENST00000362985 TRAV4A0A0B4J268 109 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-490P-201ENST00000362985 A8MT66 165 aa-1.1□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.7 ms