RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNRNP25-201ENST00000293861 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa15.92■□□□□ 0.14
SNRNP25-201ENST00000293861 C20orf202A1L168 122 aa15.92■□□□□ 0.14
SNRNP25-201ENST00000293861 INAFM1C9JVW0 142 aa15.92■□□□□ 0.14
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SNRNP25-201ENST00000293861 Q8N8P6 123 aa15.91■□□□□ 0.14
SNRNP25-201ENST00000293861 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.9■□□□□ 0.14
SNRNP25-201ENST00000293861 POM121L12Q8N7R1 296 aa15.9■□□□□ 0.14
SNRNP25-201ENST00000293861 C9orf85Q96MD7 179 aa15.9■□□□□ 0.14
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP6D1Q9H9H5 199 aa15.9■□□□□ 0.14
SNRNP25-201ENST00000293861 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa15.9■□□□□ 0.14
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
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SNRNP25-201ENST00000293861 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 CUBNO60494 3623 aa15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 LINC01545Q5VT33 79 aa15.88■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 ATOH7Q8N100 152 aa15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 Q8N1Y9 231 aa15.87■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 FCER1GP30273 86 aa15.86■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 CLUHP3Q96NS8 147 aa15.86■□□□□ 0.13
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SNRNP25-201ENST00000293861 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 C20orf78Q9BR46 151 aa15.85■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
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SNRNP25-201ENST00000293861 LINC00315P59091 139 aa15.84■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 RASL10AQ92737 203 aa15.84■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 MDFICQ9P1T7 246 aa15.84■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP1R17O96001 155 aa15.84■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.84■□□□□ 0.13
SNRNP25-201ENST00000293861 IGLC3P0DOY3 106 aa15.83■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF124Q15973 351 aa15.83■□□□□ 0.12
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SNRNP25-201ENST00000293861 RBMY1CP0DJD4 496 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 SMIM17P0DL12 118 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 FXYD7P58549 80 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 MAJINQ3KP22 176 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 SYT8Q8NBV8 401 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 SMIM2Q9BVW6 85 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 CRLF1O75462 422 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 MGPP08493 103 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 IFI27L1Q96BM0 104 aa15.82■□□□□ 0.12
SNRNP25-201ENST00000293861 K7EMI3 77 aa15.81■□□□□ 0.12
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