RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV4-59P01825 116 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IL4P05112 153 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00271P0C7V0 271 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 CD28P10747 220 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A16P16260 332 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 GCHFRP30047 84 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 EFNA4P52798 201 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 BRWD1-AS2P59051 145 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 GNB1P62873 340 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF117Q03924 483 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 REG3AQ06141 175 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IL17AQ16552 155 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 FAM216BQ8N7L0 139 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 NUP37Q8NFH4 326 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 ITLN1Q8WWA0 313 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A2Q9BXI2 301 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 GNG13Q9P2W3 67 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 EP400Q96L91 3159 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SCN7AQ01118 1682 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 NUP98P52948 1817 aa2.21□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 BRWD3Q6RI45 1802 aa2.21□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 NUMA1Q14980 2115 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 DOCK9Q9BZ29 2069 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GVY2 172 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 A6NIN4 97 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 E7EQL1 145 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 J3QRE1 110 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 NPYP01303 97 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3-43DP0DP04 118 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 CCL4P13236 92 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV1-2P23083 117 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP10-3P60369 221 aa2.21□□□□□ -2.06
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PTPRM-204ENST00000577468 UBE2D2P62837 147 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 SERF2P84101 59 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 Q1T7F1 81 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 FAM72AQ5TYM5 149 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM61Q8N0U2 210 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 DAND5Q8N907 189 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf52Q96A22 123 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 RMI2Q96E14 147 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 DYNLRB1Q9NP97 96 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 TAC3Q9UHF0 121 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF236Q9UL36 1845 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 DLEC1Q9Y238 1755 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 GTF3C1Q12789 2109 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 DOCK7Q96N67 2140 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf84I3L1E1 186 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 J3QLW9 94 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 K7EQD1 137 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A20O43772 301 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 LEPROTL1O95214 131 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV4-39P01824 125 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1-16P04430 117 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS1P07477 247 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS2P07478 247 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 PIRTP0C851 137 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 FXYD2P54710 66 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 BSPH1Q075Z2 132 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 RHOHQ15669 191 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 C9orf57Q5W0N0 161 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 PDPNQ86YL7 162 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IFI27L1Q96BM0 104 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 CEP350Q5VT06 3117 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 COL18A1P39060 1754 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 TIAM2Q8IVF5 1701 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 FER1L5A0AVI2 2057 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD36A6QL64 1941 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 CACNA1AO00555 2505 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa2.19□□□□□ -2.06
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