RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736	INSL3	P51460	131 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF575	Q86XF7	245 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	APCS	P02743	223 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	NAGK	Q9UJ70	344 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	KIR3DS1	Q14943	382 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736		Q6ZQT7	251 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	KCNS1	Q96KK3	526 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	C5orf52	A6NGY3	159 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736		M0R2Z0	102 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	NDUFA6	P56556	154 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	GATD1	Q8NB37	220 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	OR5AL1	P0C617	328 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	ASIP	P42127	132 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF124	Q15973	351 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	SLA	Q13239	276 aa		13.46	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	MUC21	Q5SSG8	566 aa		13.46	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	MED14OS	P0DP75	135 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	TDRG1	Q3Y452	100 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	STH	Q8IWL8	128 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	SORL1	Q92673	2214 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	ATR	Q13535	2644 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	SNAI2	O43623	268 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	TWIST1	Q15672	202 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	AMBP	P02760	352 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	NTF3	P20783	257 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	CACNG7	P62955	275 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	UBE2C	O00762	179 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	MAST4	O15021	2626 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736		H3BVH4	76 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	HOXA5	P20719	270 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	CD7	P09564	240 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	SRI	P30626	198 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	SST	P61278	116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	AGRN	O00468	2067 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	GNRH2	O43555	120 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	FXYD7	P58549	80 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	C3orf56	Q8N813	242 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736		Q0VG73	95 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEG3-227	ENST00000556736	INS	P01308	110 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MEG3-227	ENST00000556736	BAGE3	Q86Y29	109 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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