RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C8orf49Q96NF6 230 aa11.58□□□□□ -0.56
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPDR1Q9UM22 224 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF479Q96JC4 524 aa11.57□□□□□ -0.56
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.54□□□□□ -0.56
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 NXPH4O95158 308 aa11.52□□□□□ -0.57
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRIP30626 198 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFP69Q49AA0 526 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMUG1Q53HV7 270 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.52□□□□□ -0.57
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYTL1Q9NRR1 136 aa11.51□□□□□ -0.57
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00479Q96M42 142 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C9orf85Q96MD7 179 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RS1O15537 224 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RYR1P21817 5038 aa11.47□□□□□ -0.57
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PEX7O00628 323 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TIRAPP58753 221 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBE2G2P60604 165 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV34A0A0B4J273 112 aa11.46□□□□□ -0.57
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF345Q14585 488 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.46□□□□□ -0.57
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.45□□□□□ -0.58
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 HMSDA8MTL9 139 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDK2AP2O75956 126 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FHITP49789 147 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STOML3Q8TAV4 291 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.45□□□□□ -0.58
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFP30Q9Y2G7 519 aa11.45□□□□□ -0.58
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