RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 BTF3L4Q96K17 158 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 BIN3Q9NQY0 253 aa4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM189A5PLL7 270 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 IFITM10A6NMD0 228 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 A8MWL6 223 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SNURFLB1AK76 121 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 K7EQG2 157 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 CCL24O00175 119 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SPRY2O43597 315 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 NDUFA7O95182 113 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 S100A6P06703 90 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 CAMPP49913 170 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 PROK1P58294 105 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SCGB2A2Q13296 93 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SMUG1Q53HV7 270 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 PSMG4Q5JS54 123 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 OR4B1Q8NGF8 309 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TPPP3Q9BW30 176 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.57□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1B0GXF2 115 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 F2Z2F3 143 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 OVOL1O14753 267 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TCF21O43680 179 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 NUPR1O60356 82 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 CRLF1O75462 422 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 IGKV3-20P01619 116 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 ORM1P02763 201 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 ID1P41134 155 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 AKR1D1P51857 326 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SLAQ13239 276 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 PET117Q6UWS5 81 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.56□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 CUBNO60494 3623 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 F8P00451 2351 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 BAHCC1Q9P281 2608 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 XKRY2A2RUG3 117 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 KNCNA6PVL3 124 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 M0QZ24 198 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 APCSP02743 223 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 BMI1P35226 326 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 IQCJQ1A5X6 159 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 LINC00477Q96M19 166 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 NAGKQ9UJ70 344 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.55□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 A0A0J9YX75 114 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 GPX1P07203 203 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 IGLC6P0CF74 106 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SRIP30626 198 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 FXYD7P58549 80 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB131AP59861 70 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 HBBP68871 147 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 WDR73Q6P4I2 378 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.54□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1B0GUT8 65 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 FAM231BA6NCW3 169 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 A8MZ25 164 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 M0R2Z0 102 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 GNRH2O43555 120 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 HLA-DQA1P01909 254 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms