RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-215	ENST00000442447	TYMS	P04818	313 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-215	ENST00000442447	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-215	ENST00000442447	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-215	ENST00000442447	ZNF345	Q14585	488 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-215	ENST00000442447	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-215	ENST00000442447	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-215	ENST00000442447	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-215	ENST00000442447	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM39-215	ENST00000442447		A0A1B0GVY2	172 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	GCG	P01275	180 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	IFNA7	P01567	189 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	SFTA3	P0C7M3	94 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	FHL2	Q14192	279 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	RASL10A	Q92737	203 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447		Q9H8V8	135 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	PRO0255	Q9UI72	69 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	CRYBA4	P53673	196 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	ZNF479	Q96JC4	524 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	KCNS1	Q96KK3	526 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	HMSD	A8MTL9	139 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447		M0R2P5	195 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	PEX7	O00628	323 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	FHIT	P49789	147 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	SLA	Q13239	276 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	UPK3B	Q9BT76	320 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447		A0A0D9SG52	128 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	BCL2L11	O43521	198 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	PPT1	P50897	306 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	STOML3	Q8TAV4	291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	PKD1	P98161	4303 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447		Q86TA4	180 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447	PKHD1	P08F94	4074 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-215	ENST00000442447		C9JCJ5	164 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	CST9LP1	Q5W188	147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447		K7EQD1	137 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	TMUB2	Q71RG4	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	AKAP14	Q86UN6	197 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447		A0A1B0GV50	99 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	PFDN1	O60925	122 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	NXPH4	O95158	308 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	GYPE	P15421	78 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	SRI	P30626	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	TNP2	Q05952	138 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	ZNF876P	Q49A33	203 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	PAGE4	O60829	102 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	ORM1	P02763	201 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	SIVA1	O15304	175 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	UBE2G1	P62253	170 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM39-215	ENST00000442447	RS1	O15537	224 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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