RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 M0R2Z0 102 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 CACNG7P62955 275 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 C20orf173Q96LM9 149 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 TPPP3Q9BW30 176 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.57□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 RNF114Q9Y508 228 aa7.57□□□□□ -1.2
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POLR1A-204ENST00000424089 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 MED14OSP0DP75 135 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 NTF3P20783 257 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 TWIST1Q15672 202 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 ORMDL3Q8N138 153 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 ODF3Q96PU9 254 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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POLR1A-204ENST00000424089 TMEM213A2RRL7 107 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 SNAI2O43623 268 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 DDTP30046 118 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 KRTDAPP60985 99 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 PMCHL1Q16048 86 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF575Q86XF7 245 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 DCANP1Q8TF63 244 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 PRELID3AQ96N28 172 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 A0A087WW49 117 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 C20orf202A1L168 122 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 LINC01619G3V211 115 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 C3orf79P0CE67 100 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 CKS2P33552 79 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 LEPP41159 167 aa7.53□□□□□ -1.2
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POLR1A-204ENST00000424089 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 FA2HQ7L5A8 372 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 VAMP8Q9BV40 100 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 PEMTQ9UBM1 199 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 RYR3Q15413 4870 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1A-204ENST00000424089 C2orf70A6NJV1 201 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 KLLNB2CW77 178 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 D6R8Y8 96 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 K7EQG2 157 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 LEPROTL1O95214 131 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 ASIPP42127 132 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 SYNJ2BPP57105 145 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 PROK1P58294 105 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 CTAG1AP78358 180 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 AMN1Q8IY45 258 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 DEFB125Q8N687 156 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 LINC01006Q8NI28 216 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS47A8MTI9 375 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 TSPOP30536 169 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP10-3P60369 221 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 PET117Q6UWS5 81 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 Q8N976 141 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 MRAPQ8TCY5 172 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 DPF1Q92782 380 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 PRO1933Q9H354 126 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1A-204ENST00000424089 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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