RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 C18orf15Q96N68 181 aa14.56□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 A0A096LNT2 108 aa14.55□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 COX8AP10176 69 aa14.55□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 SMPXQ9UHP9 88 aa14.55□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 FCER1GP30273 86 aa14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 NUDT3O95989 172 aa14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 TGFAP01135 160 aa14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 COX6B1P14854 86 aa14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 PSMB8P28062 276 aa14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 C10orf99Q6UWK7 81 aa14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 Q6ZVH6 145 aa14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 Q8N8P6 123 aa14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.54□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.53□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 SPRY2O43597 315 aa14.53□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 NRACQ8N912 160 aa14.53□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.53□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 ZNF580Q9UK33 172 aa14.53□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 USP24Q9UPU5 2620 aa14.52□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.52□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 A1L4Q6 167 aa14.52□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 KIR3DS1Q14943 382 aa14.52□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.52□□□□□ -0.08
USP21-201ENST00000289865 K7EMT4 169 aa14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 S100A4P26447 101 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 TCTAP57738 103 aa14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 DPF1Q92782 380 aa14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 DKK2Q9UBU2 259 aa14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 J3QLI3 93 aa14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 M0R381 172 aa14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 ASIPP42127 132 aa14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.51□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 POLQO75417 2590 aa14.5□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 COX11Q9Y6N1 276 aa14.5□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 ZNF124Q15973 351 aa14.5□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.5□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.5□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.49□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.49□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 FBN2P35556 2912 aa14.49□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 RNF223E7ERA6 249 aa14.49□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 FGF6P10767 208 aa14.49□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.49□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.49□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 PRSS47A8MTI9 375 aa14.48□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 ID1P41134 155 aa14.48□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 MRAP2Q96G30 205 aa14.48□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.47□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 GNRH2O43555 120 aa14.47□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 DCANP1Q8TF63 244 aa14.47□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.47□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 CD5LO43866 347 aa14.47□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 PRSS1P07477 247 aa14.47□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 LAGE3Q14657 143 aa14.47□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 DEFB125Q8N687 156 aa14.47□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 LRRK2Q5S007 2527 aa14.47□□□□□ -0.09
USP21-201ENST00000289865 ZANQ9Y493 2812 aa14.46□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 SMIM17P0DL12 118 aa14.46□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 ODF1Q14990 250 aa14.46□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 TMEM89A2RUT3 159 aa14.45□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 MED14OSP0DP75 135 aa14.45□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.45□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.45□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.45□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.44□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 FOXC2Q99958 501 aa14.44□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 CR1P17927 2039 aa14.44□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 KLLNB2CW77 178 aa14.44□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.44□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.44□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 ZNF843Q8N446 348 aa14.44□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 MGPP08493 103 aa14.43□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 NMUP48645 174 aa14.43□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 KRTAP10-9P60411 292 aa14.43□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 SMIM2Q9BVW6 85 aa14.43□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 CENPEQ02224 2701 aa14.43□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 TAX1BP3O14907 124 aa14.43□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 RASL10AQ92737 203 aa14.43□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 ZMAT4Q9H898 229 aa14.43□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 ATP5LO75964 103 aa14.42□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 FSHBP01225 129 aa14.42□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 ZNF688P0C7X2 276 aa14.42□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.42□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 MUC4Q99102 2169 aa14.42□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 PSMG4Q5JS54 123 aa14.41□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 Q6YL49 198 aa14.41□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 PCP2Q8IVA1 136 aa14.41□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 PTPN13Q12923 2485 aa14.41□□□□□ -0.1
USP21-201ENST00000289865 SYNJ2BPP57105 145 aa14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms