RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 GAGE1Q13065 139 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GAGE4Q13068 117 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GAGE5Q13069 117 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GAGE13Q4V321 117 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 PRAC2D3DTV9 90 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 PLNP26678 52 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 TDGF1P3P51864 188 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 PAX2Q02962 417 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 TTC32Q5I0X7 151 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 DKK2Q9UBU2 259 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 NCKAP5O14513 1909 aa4.33□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 FAM223BA6NKX1 122 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 LINC01548A6NM66 108 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 MALP21145 153 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 DSCR9P59020 149 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 KMT2EQ8IZD2 1858 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GAGE12BA1L429 117 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GAGE7O76087 117 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 CTSGP08311 255 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GAGE12FP0CL80 117 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GAGE12GP0CL81 117 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GAGE12IP0CL82 117 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 SLC25A16P16260 332 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 THAP8Q8NA92 274 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 CDH23Q9H251 3354 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 VPS13AQ96RL7 3174 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 VWC2LB2RUY7 222 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 PAX4O43316 350 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 Q8N7P7 452 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 ZNF492Q9P255 531 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.32□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 IGLV1-47P01700 117 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 SEC11AP67812 179 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 CFAP161Q6P656 301 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 CFHR4Q92496 578 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 ERG28Q9UKR5 140 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 PRSS46E5RG02 174 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 I3L2K1 104 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 ESDP10768 282 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 AMTNQ6UX39 209 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 Q8N9W7 124 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 FAM231BA6NCW3 169 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 TSPAN13O95857 204 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 PCP2Q8IVA1 136 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 AJUBAQ96IF1 538 aa4.31□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 TMEM131Q92545 1883 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GP9P14770 177 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 PTPRSQ13332 1948 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 K7ERJ3 54 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 NDUFS8O00217 210 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 TRBV12-3P01733 135 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 PFN2P35080 140 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 CDKN1BP46527 198 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 SLURP1P55000 103 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 UBE2V1Q13404 147 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 ETDBQ3ZM63 59 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GATD1Q8NB37 220 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GTSF1Q8WW33 167 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 MGAQ8IWI9 3026 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 NDUFA4O00483 81 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 INSP01308 110 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 CT83Q5H943 113 aa4.3□□□□□ -1.72
LMO3-201ENST00000261169 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms