RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599		Q8TAT8	98 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TARDBP-231	ENST00000639599	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	CRYBA4	P53673	196 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	TAS2R45	P59539	299 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	NHLH2	Q02577	135 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	MUC21	Q5SSG8	566 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	NAGK	Q9UJ70	344 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	PKD1	P98161	4303 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	EPM2A	B3EWF7	344 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	PRAF2	O60831	178 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	ORM1	P02763	201 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	EVI2A	P22794	236 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	PRR9	Q5T870	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	RBAKDN	A6NC62	111 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	PET100	P0DJ07	73 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	IL15RA	Q13261	267 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	KHDC3L	Q587J8	217 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	S100Z	Q8WXG8	99 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	SPX	Q9BT56	116 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	NMES1	Q9C002	83 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599		C9JCJ5	164 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	SIX6	O95475	246 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	GYPE	P15421	78 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	FHL2	Q14192	279 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF266	Q14584	549 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP5S	Q99766	215 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599		K7EP13	123 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	SFTA3	P0C7M3	94 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	ASAH1	Q13510	395 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599		K7EQD1	137 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	PSCA	O43653	123 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	PPT1	P50897	306 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF479	Q96JC4	524 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TARDBP-231	ENST00000639599		Q6AWC8	147 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599		Q6ZQT7	251 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	FRZB	Q92765	325 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PPV4	95 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	SSNA1	O43805	119 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	RASL10A	Q92737	203 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	HSPG2	P98160	4391 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A087WTM6	91 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	PGP	A6NDG6	321 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599		M0R2P5	195 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	CRYGD	P07320	174 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81	3e-10	■■□□□ 12.1
TARDBP-231	ENST00000639599	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	TMED6	Q8WW62	240 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	KCNS1	Q96KK3	526 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	MBD2	Q9UBB5	411 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TARDBP-231	ENST00000639599	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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