RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 Q8NAQ8 132 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TVP23CQ96ET8 276 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 C17orf77Q96MU5 243 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 ATG101Q9BSB4 218 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 SMPXQ9UHP9 88 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 PGPA6NDG6 321 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 PEX7O00628 323 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TCRAP04437 139 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 PAFAH1B2P68402 229 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 STHQ8IWL8 128 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 BLNKQ8WV28 456 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 EPM2AB3EWF7 344 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 M0R036 132 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 SLC17A3O00476 420 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 CHEK1O14757 476 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 AKR1C3P42330 323 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZR54 194 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01551Q86U37 167 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 FMC1Q96HJ9 113 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 DERL1Q9BUN8 251 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 RBAKDNA6NC62 111 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 K7EQM0 130 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 SOCS3O14543 225 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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SMAD3-215ENST00000560424 CEBPGP53567 150 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 RNF212Q495C1 297 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 MLST8Q9BVC4 326 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 NRN1Q9NPD7 142 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.68□□□□□ -1.34
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SMAD3-215ENST00000560424 ISLRO14498 428 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV2-8P01709 118 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 CSN1S1P47710 185 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 GNG4P50150 75 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TNP2Q05952 138 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 SMUG1Q53HV7 270 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 PPP1R2P9O14990 202 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 LTAP01374 205 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV2-11P01706 119 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 MT-ND4LP03901 98 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2G1P62253 170 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 PSG3Q16557 428 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 C12orf74Q32Q52 190 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 CENPWQ5EE01 88 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 ISOC2Q96AB3 205 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 BTF3L4Q96K17 158 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.66□□□□□ -1.34
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SMAD3-215ENST00000560424 CELA1Q9UNI1 258 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 COLCA2A8K830 154 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 H3BTX0 84 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 M0R3E3 92 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 GCGP01275 180 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB131AP59861 70 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 GNG5P63218 68 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 ADIRFQ15847 76 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.65□□□□□ -1.34
SMAD3-215ENST00000560424 TCF24Q7RTU0 167 aa6.65□□□□□ -1.34
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