RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 F8W735 103 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 NPY1RP25929 384 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 KIR3DS1Q14943 382 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 BAGE3Q86Y29 109 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 BAGE2Q86Y30 109 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CS-212ENST00000548567 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 RHOBP62745 196 aa5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 HBG1P69891 147 aa5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 HBG2P69892 147 aa5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 PRR27Q6MZM9 219 aa5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 RNF5Q99942 180 aa5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 FAM223BA6NKX1 122 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 CHEK1O14757 476 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 PMCHL1Q16048 86 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 PET117Q6UWS5 81 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 Q6ZVH6 145 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 NRN1Q9NPD7 142 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 A0A096LPF7 62 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 INSL3P51460 131 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 NIT1Q86X76 327 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 C17orf77Q96MU5 243 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 SPATA25Q9BR10 227 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 RNF24Q9Y225 148 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 PDE6DO43924 150 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 IGKV1-17P01599 117 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 STPG3Q8N7X2 389 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 BLNKQ8WV28 456 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 SMPXQ9UHP9 88 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 S100A7P31151 101 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 PRCDQ00LT1 54 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 KMT2AQ03164 3969 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 COX19Q49B96 90 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 FAM71F2Q6NXP2 309 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 KCNS1Q96KK3 526 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 METTL26Q96S19 204 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 I3L2K1 104 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 AMTP48728 403 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 ARL16Q0P5N6 197 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 Q6ZS49 121 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 RNF152Q8N8N0 203 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 SFRP2Q96HF1 295 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 LINC00477Q96M19 166 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 IL36BQ9NZH7 164 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 TAX1BP3O14907 124 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 PAGE4O60829 102 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 MT-ND6P03923 174 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 C3orf79P0CE67 100 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 PSENENQ9NZ42 101 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.525e-7■■■■□ 21.2
CS-212ENST00000548567 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 C16orf92Q96LL3 132 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 OR4C46A6NHA9 309 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 C11orf94C9JXX5 98 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 F2Z2F3 143 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 CORTO00230 105 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 SYNGR2O43760 224 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 SCGB1A1P11684 91 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 WDR73Q6P4I2 378 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 Q6ZTC4 211 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 IGHV3-53P01767 116 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 CRYGCP07315 174 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 GPHB5Q86YW7 130 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-212ENST00000548567 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.55□□□□□ -1.52
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