RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YIPF6Q96EC8 236 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOSTQ9BQB4 213 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYNGR2O43760 224 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM127O75204 238 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MED6O75586 246 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NMBP08949 121 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBPP20226 339 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GUK1Q16774 197 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF492Q9P255 531 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR132Q9UNW8 380 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A087WX48 190 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HPGDSO60760 199 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOA1P02647 267 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAS2R19P59542 299 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM25AB3EWG3 89 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM25CB3EWG5 89 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM25GB3EWG6 89 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H7C1H1 209 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAAR5O14804 337 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC11BP0C7V7 166 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRG4Q8WWG1 115 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q9UF83 564 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DISC1C4P0D8 188 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFB4O95168 129 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF138P52744 262 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF546Q86UE3 836 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VAX2Q9UIW0 290 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A087WWC5 75 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGPA6NDG6 321 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABARAPL2P60520 117 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q0VG73 95 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELOBQ15370 118 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF876PQ49A33 203 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C4orf46Q504U0 113 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ENHOQ6UWT2 76 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF185Q96GF1 192 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSENENQ9NZ42 101 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRELID1Q9Y255 219 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM262E9PQX1 116 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRPP02741 224 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PYYP10082 97 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANXA3P12429 323 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INPP1P49441 399 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF266Q14584 549 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEDD8Q15843 81 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM231BA6NCW3 169 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 K7EPK0 472 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TYMSP04818 313 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAV2P51636 162 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRPXP78539 464 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGST2Q99735 147 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 hDV102S1A0JD36 115 aa6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSSCA1O60232 199 aa6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXB5P09067 269 aa6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
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