RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 SERP2Q8N6R1 65 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TSKUQ8WUA8 353 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 C4orf45Q96LM5 186 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 ESM1Q9NQ30 184 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 DEPPQ9NTK1 212 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 RELNP78509 3460 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 F2Z2F3 143 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 H0Y9J4 135 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 PCP2Q8IVA1 136 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6ZVQ6 151 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 LCA10Q71F78 164 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 C3orf56Q8N813 242 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 C18orf12Q96KH6 178 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 CENPEQ02224 2701 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A0G2JK05 382 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 hADV29S1A0JD25 119 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 C2orf70A6NJV1 201 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 K7EM74 188 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 WNT9BO14905 357 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 CAV3P56539 151 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 MKXQ8IYA7 352 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 MORN4Q8NDC4 146 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 CTSZQ9UBR2 303 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 AQP1P29972 269 aa6.71□□□□□ -1.34
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RABGGTB-214ENST00000497648 SMIM11AP58511 58 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 HBBP68871 147 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB134Q4QY38 66 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6ZQT7 251 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 C5orf38Q86SI9 138 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 ODF3Q96PU9 254 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 CCL13Q99616 98 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 COL12A1Q99715 3063 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A087WZ39 114 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 M0R378 163 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 PCBD1P61457 104 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 CACNG7P62955 275 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 PCSK4Q6UW60 755 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00643Q86TS7 51 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF329Q86UD4 541 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 SPACA5Q96QH8 159 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A22Q9H936 323 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 PTPN13Q12923 2485 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 HCFC1P51610 2035 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 WISP2O76076 250 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 MP68P56378 58 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 DCANP1Q8TF63 244 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-214ENST00000497648 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
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