RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1QBP02746 253 aa-0.3□□□□□ -2.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.3□□□□□ -2.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP19Q96LK0 163 aa-0.3□□□□□ -2.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMIM7Q9BQ49 75 aa-0.3□□□□□ -2.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATG5Q9H1Y0 275 aa-0.3□□□□□ -2.46
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-0.32□□□□□ -2.46
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MED11Q9P086 117 aa-0.35□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-0.35□□□□□ -2.47
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTXN2P0C2S0 81 aa-0.36□□□□□ -2.47
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LXNQ9BS40 222 aa-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM242Q9NWH2 141 aa-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASB4Q9Y574 426 aa-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TANC1Q9C0D5 1861 aa-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F5P12259 2224 aa-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APC2O95996 2303 aa-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa-0.36□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.37□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.37□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF292O60281 2723 aa-0.37□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.37□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NMBP08949 121 aa-0.37□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CKS2P33552 79 aa-0.37□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERVS71-1P61550 626 aa-0.37□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STX19Q8N4C7 294 aa-0.37□□□□□ -2.47
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